Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Syna-201ENSMUST00000149604 2026 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Btc-201ENSMUST00000121044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Gm8914-201ENSMUST00000101396 1035 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Gm5071-201ENSMUST00000104922 1035 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Gm16013-201ENSMUST00000152249 353 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Gm42875-201ENSMUST00000197674 1015 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Pf4-203ENSMUST00000202625 411 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 CR974487.1-201ENSMUST00000220984 413 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 AC154766.1-201ENSMUST00000226550 936 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Gm5072-201ENSMUST00000063726 1035 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Hsdl1-204ENSMUST00000212517 2215 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Plbd1-201ENSMUST00000032336 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Fcgr3-204ENSMUST00000169017 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Gm43362-201ENSMUST00000198192 2470 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Ppp1r9a-206ENSMUST00000175962 3769 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Gm14111-201ENSMUST00000119851 999 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Gemin7-205ENSMUST00000122127 652 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 H2afy3-201ENSMUST00000151919 1112 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Tmem229b-ps-201ENSMUST00000168554 506 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Gm26241-201ENSMUST00000174944 101 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Gm23976-201ENSMUST00000175001 101 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Gm22463-201ENSMUST00000175274 101 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Gm22547-201ENSMUST00000175281 101 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Gm22913-201ENSMUST00000175297 101 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Gm23282-201ENSMUST00000175306 101 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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Usp54Q8BL06 Gm26235-201ENSMUST00000175533 101 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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Usp54Q8BL06 Gm24973-201ENSMUST00000175588 101 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Gm23292-201ENSMUST00000175618 101 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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Usp54Q8BL06 Gm25458-201ENSMUST00000178981 101 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Gm22825-201ENSMUST00000179444 101 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 2810049E08Rik-201ENSMUST00000185600 1102 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Mpzl1-203ENSMUST00000191818 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Gm42764-201ENSMUST00000197835 741 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Cox7a1-202ENSMUST00000208441 485 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 AC156016.4-201ENSMUST00000227470 647 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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Usp54Q8BL06 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Oprk1-201ENSMUST00000027038 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 AC132833.1-202ENSMUST00000228875 1690 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Rdh7-201ENSMUST00000047199 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Usp54Q8BL06 Vegfa-204ENSMUST00000113520 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Usp54Q8BL06 Gm43833-201ENSMUST00000198828 293 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Mpv17-204ENSMUST00000200864 878 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 AC102523.2-201ENSMUST00000227813 983 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Fam216b-202ENSMUST00000118785 1447 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Etv1-204ENSMUST00000160701 1578 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Gm20953-201ENSMUST00000216399 2614 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Ttll7-203ENSMUST00000106134 2664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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