Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Tchhl1-201ENSMUST00000029516 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26912-201ENSMUST00000180988 1483 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 D030055H07Rik-202ENSMUST00000150953 4325 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Ppp2r2a-201ENSMUST00000089230 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp384-201ENSMUST00000046064 3108 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 AC140462.2-201ENSMUST00000225718 2433 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Atxn1l-201ENSMUST00000093162 7526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Robo4-203ENSMUST00000115048 3392 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr95-201ENSMUST00000060728 5129 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Psat1-205ENSMUST00000162053 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Pdgfra-202ENSMUST00000168162 6834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Elmo3-201ENSMUST00000109375 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Rrm2b-201ENSMUST00000022901 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Col4a6-201ENSMUST00000101205 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Sf3b5-201ENSMUST00000105139 3841 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Kcng4-201ENSMUST00000061828 3806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Anapc15-213ENSMUST00000178851 2797 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Fam161a-201ENSMUST00000058269 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc62-202ENSMUST00000165148 3920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Ampd2-201ENSMUST00000078912 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 4930557B06Rik-201ENSMUST00000200193 381 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Ppp1r3c-201ENSMUST00000087321 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Mybpc3-201ENSMUST00000111430 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Gm42450-201ENSMUST00000199286 2644 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Styx-205ENSMUST00000226873 12974 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Synpo2l-203ENSMUST00000119483 3696 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Tro-201ENSMUST00000087253 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Nr1i2-201ENSMUST00000023504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Itih3-205ENSMUST00000227995 2100 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Gfra2-203ENSMUST00000227697 1323 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 4930488L21Rik-202ENSMUST00000212638 3164 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr1349-206ENSMUST00000213656 4492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Ticam1-201ENSMUST00000058136 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44888-201ENSMUST00000209119 2541 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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