Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Adam20-201ENSMUST00000056331 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Nrap-202ENSMUST00000073536 5501 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Capn15-204ENSMUST00000212149 4555 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Gtf2ird1-206ENSMUST00000111244 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Slc17a8-202ENSMUST00000105295 1863 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Cyp2j13-202ENSMUST00000097973 1648 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Gm17151-201ENSMUST00000105760 367 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Lypla1-202ENSMUST00000115529 930 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Gm15968-201ENSMUST00000119342 1168 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Mpv17l-202ENSMUST00000124947 768 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 6820431F20Rik-201ENSMUST00000150051 936 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Ap1g1-206ENSMUST00000179104 1096 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Prm2-202ENSMUST00000189593 674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Gm34379-201ENSMUST00000195036 290 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Gm40332-201ENSMUST00000199847 938 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Gm43249-201ENSMUST00000200464 458 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1358-201ENSMUST00000204477 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Gm44605-201ENSMUST00000206892 949 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Gm45258-201ENSMUST00000210042 853 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Hcst-201ENSMUST00000075062 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Taar5-201ENSMUST00000092659 1014 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Eef1b2-204ENSMUST00000129339 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Tcaf1-202ENSMUST00000045140 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Gm13104-201ENSMUST00000119651 1446 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Eif2s3y-201ENSMUST00000091197 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 C130021I20Rik-201ENSMUST00000147294 3693 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Cxcl11-201ENSMUST00000077820 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Gm19951-201ENSMUST00000222616 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Nrap-205ENSMUST00000167239 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 4930432L08Rik-201ENSMUST00000132154 1608 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Myo1c-203ENSMUST00000102505 4652 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Nav2-204ENSMUST00000183659 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Eapp-202ENSMUST00000110713 886 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Ccl19-ps1-201ENSMUST00000119621 327 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Gm16217-201ENSMUST00000124182 616 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 9230111E07Rik-201ENSMUST00000124850 811 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Gm13780-201ENSMUST00000150482 1187 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Atad3aos-202ENSMUST00000150777 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Gm37988-201ENSMUST00000155020 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms