Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS3

Ssx9, MCG116991, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx9Q6XAS3 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Lrrc49-204ENSMUST00000114034 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Lin54-210ENSMUST00000154921 3734 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Mymk-201ENSMUST00000009358 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Gm12530-201ENSMUST00000152074 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Ppp1r3c-201ENSMUST00000087321 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Ptbp3-201ENSMUST00000030076 6855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Mtch2-202ENSMUST00000111467 2281 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Edn1-201ENSMUST00000021796 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 AI854703-202ENSMUST00000154570 3806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Arhgap45-202ENSMUST00000099501 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Gm15832-201ENSMUST00000146314 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Gm8122-201ENSMUST00000165988 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Spert-201ENSMUST00000035243 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Adat1-202ENSMUST00000120457 1677 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Rep15-201ENSMUST00000036194 1662 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Zfp474-201ENSMUST00000072666 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Gpr155-204ENSMUST00000112044 4201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Gm27953-201ENSMUST00000185171 143 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Gm38313-201ENSMUST00000191953 1266 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Gm37860-201ENSMUST00000195380 1034 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 A830092H15Rik-202ENSMUST00000195446 649 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Gm42710-201ENSMUST00000200608 985 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Rpl15-ps5-201ENSMUST00000205636 605 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 AC165249.1-202ENSMUST00000217990 734 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Olfr1199-201ENSMUST00000099813 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Mdm1-203ENSMUST00000164077 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Il10ra-202ENSMUST00000176222 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Gm43274-201ENSMUST00000202545 5000 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Uspl1-202ENSMUST00000100410 3148 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Nr4a2-201ENSMUST00000028166 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 C130013H08Rik-201ENSMUST00000197569 3692 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Rgs12-204ENSMUST00000114281 3439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Pcdh15-233ENSMUST00000191709 5346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Plekha7-206ENSMUST00000182487 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Marveld2-201ENSMUST00000022137 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 4933439C10Rik-203ENSMUST00000132226 3184 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Lrfn5-202ENSMUST00000119481 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Mx1-202ENSMUST00000113768 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Gm11824-201ENSMUST00000120191 846 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Aamdc-209ENSMUST00000144858 380 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 4930471C04Rik-201ENSMUST00000166038 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Gm31520-203ENSMUST00000204874 647 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Kcng4-201ENSMUST00000061828 3806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 C1rb-201ENSMUST00000184647 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Gpi1-201ENSMUST00000038027 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 4933422A05Rik-201ENSMUST00000213706 1356 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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