Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Hormad2-202ENSMUST00000109948 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Tpm1-205ENSMUST00000113685 1208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Gm14633-201ENSMUST00000121152 470 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Gm13393-201ENSMUST00000141935 396 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Gm12207-201ENSMUST00000143016 494 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Gm26208-201ENSMUST00000158677 124 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Gal3st2b-201ENSMUST00000177958 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Gm17733-201ENSMUST00000181883 1048 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Mir6396-201ENSMUST00000183603 111 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Gm28391-201ENSMUST00000185202 379 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 BC025446-202ENSMUST00000185307 758 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Gm29528-201ENSMUST00000186699 379 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Gm29526-201ENSMUST00000187217 379 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Pik3r4-206ENSMUST00000188784 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Gm28826-201ENSMUST00000190006 488 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Gm6370-202ENSMUST00000198912 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Gm42710-201ENSMUST00000200608 985 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Gm44196-203ENSMUST00000204359 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Smim23-201ENSMUST00000020508 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Gm5650-201ENSMUST00000209641 598 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 AC140409.3-201ENSMUST00000215601 358 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Tnfrsf14-205ENSMUST00000219534 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Gm34983-202ENSMUST00000220432 494 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 CU025215.1-201ENSMUST00000222986 603 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Gm8618-201ENSMUST00000097570 432 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Matr3-216ENSMUST00000190653 1846 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Myadm-202ENSMUST00000164553 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Olfr1156-202ENSMUST00000216191 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Scmh1-203ENSMUST00000106298 1995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Npy1r-201ENSMUST00000039303 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Picalm-201ENSMUST00000049537 3528 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Stmn3-201ENSMUST00000103045 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Ighv1-12-201ENSMUST00000103500 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Ighv1-62-3-201ENSMUST00000103532 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Lyrm1-204ENSMUST00000106518 875 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Slc25a21-202ENSMUST00000110680 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Gm11235-201ENSMUST00000117763 333 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Sgcg-202ENSMUST00000121148 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Gm15373-201ENSMUST00000121495 214 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Gm16587-201ENSMUST00000161943 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Rps18-206ENSMUST00000174609 527 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Vmn2r-ps13-201ENSMUST00000176920 606 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Mok-204ENSMUST00000177224 551 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Gm42208-201ENSMUST00000198215 670 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 6720482G16Rik-201ENSMUST00000199552 1192 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Gm40332-201ENSMUST00000199847 938 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Gm20186-201ENSMUST00000201775 737 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Gm45308-201ENSMUST00000210610 415 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Galp-201ENSMUST00000037553 650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Eddm3b-201ENSMUST00000100645 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Prnd-201ENSMUST00000110169 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 4932438H23Rik-201ENSMUST00000035689 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms