Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trak1Q6PD31 Lrrc57-201ENSMUST00000102496 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trak1Q6PD31 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trak1Q6PD31 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trak1Q6PD31 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trak1Q6PD31 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trak1Q6PD31 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Trak1Q6PD31 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trak1Q6PD31 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trak1Q6PD31 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trak1Q6PD31 A930003A15Rik-201ENSMUST00000100083 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trak1Q6PD31 Gm23604-201ENSMUST00000104311 132 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Trak1Q6PD31 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Trak1Q6PD31 Gm15746-201ENSMUST00000120684 1027 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Trak1Q6PD31 Gm16227-201ENSMUST00000160088 563 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trak1Q6PD31 Ubl5-203ENSMUST00000160124 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trak1Q6PD31 Rab11a-204ENSMUST00000167569 726 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trak1Q6PD31 Gm22662-201ENSMUST00000175290 256 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Trak1Q6PD31 Rab26-204ENSMUST00000176533 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trak1Q6PD31 Gm43821-201ENSMUST00000199198 729 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trak1Q6PD31 Zfp445-205ENSMUST00000214626 1220 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trak1Q6PD31 AC159261.1-201ENSMUST00000222493 911 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trak1Q6PD31 AC149294.3-201ENSMUST00000226888 732 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Trak1Q6PD31 Ssna1-201ENSMUST00000028342 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trak1Q6PD31 Tbc1d21-201ENSMUST00000040217 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trak1Q6PD31 Cd300c2-201ENSMUST00000092464 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trak1Q6PD31 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trak1Q6PD31 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trak1Q6PD31 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trak1Q6PD31 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trak1Q6PD31 Myc-206ENSMUST00000167731 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trak1Q6PD31 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trak1Q6PD31 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trak1Q6PD31 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trak1Q6PD31 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trak1Q6PD31 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Trak1Q6PD31 Myc-208ENSMUST00000191178 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trak1Q6PD31 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trak1Q6PD31 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trak1Q6PD31 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trak1Q6PD31 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trak1Q6PD31 A1bg-201ENSMUST00000096418 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trak1Q6PD31 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trak1Q6PD31 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trak1Q6PD31 Cd300ld5-201ENSMUST00000100239 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trak1Q6PD31 Cd300ld4-201ENSMUST00000100240 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trak1Q6PD31 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trak1Q6PD31 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trak1Q6PD31 Gm13393-201ENSMUST00000141935 396 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trak1Q6PD31 Il4-204ENSMUST00000150568 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trak1Q6PD31 Rpl41-201ENSMUST00000176010 582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trak1Q6PD31 Rpl41-204ENSMUST00000176906 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trak1Q6PD31 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Trak1Q6PD31 Gm9409-201ENSMUST00000197017 316 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Trak1Q6PD31 Fxyd1-214ENSMUST00000206328 545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trak1Q6PD31 Gm6426-201ENSMUST00000209048 854 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Trak1Q6PD31 Gm2716-201ENSMUST00000212350 643 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Trak1Q6PD31 Btg4-203ENSMUST00000213680 1282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trak1Q6PD31 Gm5040-201ENSMUST00000218609 800 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Trak1Q6PD31 Ndufc1-201ENSMUST00000038108 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trak1Q6PD31 Tbata-202ENSMUST00000079235 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trak1Q6PD31 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trak1Q6PD31 Cd300ld3-201ENSMUST00000092459 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trak1Q6PD31 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trak1Q6PD31 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trak1Q6PD31 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trak1Q6PD31 Sppl2c-201ENSMUST00000059448 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trak1Q6PD31 Atp5s-201ENSMUST00000021372 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trak1Q6PD31 Amd-ps3-201ENSMUST00000072796 1496 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Trak1Q6PD31 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trak1Q6PD31 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trak1Q6PD31 Gm6713-201ENSMUST00000216137 1446 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Trak1Q6PD31 Exosc9-201ENSMUST00000029269 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trak1Q6PD31 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trak1Q6PD31 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trak1Q6PD31 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trak1Q6PD31 Ttc39a-202ENSMUST00000106618 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trak1Q6PD31 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trak1Q6PD31 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trak1Q6PD31 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trak1Q6PD31 Olfr272-202ENSMUST00000107667 1936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trak1Q6PD31 1700048O20Rik-202ENSMUST00000214777 1900 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trak1Q6PD31 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trak1Q6PD31 Gm24470-201ENSMUST00000104486 132 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Trak1Q6PD31 Guca2b-202ENSMUST00000106309 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trak1Q6PD31 Nup188-202ENSMUST00000113634 534 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trak1Q6PD31 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Trak1Q6PD31 Rpl13-ps4-201ENSMUST00000194776 628 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Trak1Q6PD31 1700048F04Rik-201ENSMUST00000199057 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trak1Q6PD31 Gm44540-201ENSMUST00000205640 354 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Trak1Q6PD31 AC132384.2-201ENSMUST00000218018 526 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Trak1Q6PD31 AC117769.1-201ENSMUST00000224716 1120 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Trak1Q6PD31 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trak1Q6PD31 Gm8615-201ENSMUST00000025307 771 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Trak1Q6PD31 Olfr47-201ENSMUST00000078057 1059 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trak1Q6PD31 Sectm1b-202ENSMUST00000081499 1222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trak1Q6PD31 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trak1Q6PD31 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trak1Q6PD31 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trak1Q6PD31 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms