Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp49Q6P9L4 Gm10031-201ENSMUST00000190422 2653 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp49Q6P9L4 Zc3h7a-201ENSMUST00000037633 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp49Q6P9L4 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp49Q6P9L4 Spert-201ENSMUST00000035243 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp49Q6P9L4 Sgk3-204ENSMUST00000171265 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp49Q6P9L4 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp49Q6P9L4 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp49Q6P9L4 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp49Q6P9L4 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp49Q6P9L4 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp49Q6P9L4 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp49Q6P9L4 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp49Q6P9L4 Gm15031-201ENSMUST00000121341 210 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp49Q6P9L4 4921508D12Rik-201ENSMUST00000124095 1075 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp49Q6P9L4 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp49Q6P9L4 Gm45716-201ENSMUST00000124877 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp49Q6P9L4 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Usp49Q6P9L4 Atad3aos-202ENSMUST00000150777 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp49Q6P9L4 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp49Q6P9L4 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp49Q6P9L4 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp49Q6P9L4 Gm4812-201ENSMUST00000182847 993 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp49Q6P9L4 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp49Q6P9L4 Fgfbp1-203ENSMUST00000199894 1228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Usp49Q6P9L4 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp49Q6P9L4 AC137950.2-201ENSMUST00000227127 1089 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp49Q6P9L4 Stx17-203ENSMUST00000107721 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Usp49Q6P9L4 Fam184b-201ENSMUST00000016023 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp49Q6P9L4 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp49Q6P9L4 Tro-201ENSMUST00000087253 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp49Q6P9L4 Ctcfl-201ENSMUST00000094287 3217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp49Q6P9L4 Slc16a7-202ENSMUST00000105257 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Usp49Q6P9L4 Cdcp2-201ENSMUST00000062495 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Cacna2d1-204ENSMUST00000115281 3412 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Usp49Q6P9L4 Aqr-202ENSMUST00000102543 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Usp49Q6P9L4 Prr16-201ENSMUST00000116639 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Usp49Q6P9L4 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Dffa-201ENSMUST00000030816 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Usp49Q6P9L4 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Usp49Q6P9L4 Capn3-206ENSMUST00000110721 2898 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Cux1-207ENSMUST00000176216 2821 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Wnt5a-202ENSMUST00000112272 3650 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Pigq-218ENSMUST00000208043 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Rnf2-201ENSMUST00000076110 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Nrros-204ENSMUST00000126869 2540 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Elf5-206ENSMUST00000164172 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Synpo2l-203ENSMUST00000119483 3696 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 C1rb-201ENSMUST00000184647 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Gm22582-201ENSMUST00000102283 94 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Gm5764-201ENSMUST00000118817 885 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Gm11824-201ENSMUST00000120191 846 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
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