Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

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Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ctnna3Q65CL1 2010111I01Rik-201ENSMUST00000021911 2979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ctnna3Q65CL1 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ctnna3Q65CL1 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ctnna3Q65CL1 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ctnna3Q65CL1 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ctnna3Q65CL1 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ctnna3Q65CL1 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ctnna3Q65CL1 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ctnna3Q65CL1 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ctnna3Q65CL1 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ctnna3Q65CL1 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ctnna3Q65CL1 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ctnna3Q65CL1 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ctnna3Q65CL1 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ctnna3Q65CL1 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ctnna3Q65CL1 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ctnna3Q65CL1 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ctnna3Q65CL1 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ctnna3Q65CL1 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ctnna3Q65CL1 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ctnna3Q65CL1 Slfn5os-201ENSMUST00000127074 574 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ctnna3Q65CL1 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ctnna3Q65CL1 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ctnna3Q65CL1 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ctnna3Q65CL1 Gm28901-201ENSMUST00000188810 474 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ctnna3Q65CL1 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ctnna3Q65CL1 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ctnna3Q65CL1 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ctnna3Q65CL1 BC049987-201ENSMUST00000213859 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ctnna3Q65CL1 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ctnna3Q65CL1 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ctnna3Q65CL1 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ctnna3Q65CL1 Elob-201ENSMUST00000069579 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ctnna3Q65CL1 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ctnna3Q65CL1 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ctnna3Q65CL1 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ctnna3Q65CL1 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ctnna3Q65CL1 Slc1a2-204ENSMUST00000111213 2093 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ctnna3Q65CL1 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ctnna3Q65CL1 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ctnna3Q65CL1 Sec13-201ENSMUST00000032440 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ctnna3Q65CL1 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ctnna3Q65CL1 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ctnna3Q65CL1 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ctnna3Q65CL1 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ctnna3Q65CL1 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ctnna3Q65CL1 Cfap61-201ENSMUST00000116398 1561 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ctnna3Q65CL1 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ctnna3Q65CL1 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ctnna3Q65CL1 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ctnna3Q65CL1 C1rl-201ENSMUST00000049124 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ctnna3Q65CL1 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ctnna3Q65CL1 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ctnna3Q65CL1 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ctnna3Q65CL1 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ctnna3Q65CL1 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ctnna3Q65CL1 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ctnna3Q65CL1 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ctnna3Q65CL1 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ctnna3Q65CL1 Platr4-203ENSMUST00000199155 2161 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ctnna3Q65CL1 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ctnna3Q65CL1 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ctnna3Q65CL1 Nln-205ENSMUST00000224945 2486 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ctnna3Q65CL1 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ctnna3Q65CL1 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ctnna3Q65CL1 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ctnna3Q65CL1 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ctnna3Q65CL1 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ctnna3Q65CL1 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ctnna3Q65CL1 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ctnna3Q65CL1 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ctnna3Q65CL1 Gm11957-201ENSMUST00000118304 779 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ctnna3Q65CL1 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ctnna3Q65CL1 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ctnna3Q65CL1 Mrpl24-204ENSMUST00000121920 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ctnna3Q65CL1 Krtcap2-204ENSMUST00000168900 582 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ctnna3Q65CL1 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ctnna3Q65CL1 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ctnna3Q65CL1 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ctnna3Q65CL1 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ctnna3Q65CL1 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ctnna3Q65CL1 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ctnna3Q65CL1 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ctnna3Q65CL1 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ctnna3Q65CL1 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ctnna3Q65CL1 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ctnna3Q65CL1 Lonp2-207ENSMUST00000163987 1556 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ctnna3Q65CL1 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ctnna3Q65CL1 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ctnna3Q65CL1 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ctnna3Q65CL1 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ctnna3Q65CL1 Slc7a3-203ENSMUST00000113710 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ctnna3Q65CL1 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ctnna3Q65CL1 Abcb8-203ENSMUST00000115077 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ctnna3Q65CL1 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ctnna3Q65CL1 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ctnna3Q65CL1 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ctnna3Q65CL1 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ctnna3Q65CL1 Ing3-202ENSMUST00000115389 2546 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms