Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm5083-202ENSMUST00000163056 1204 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 BC002189-201ENSMUST00000195674 598 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Gm7319-201ENSMUST00000210047 778 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Btg4-203ENSMUST00000213680 1282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Gm22982-201ENSMUST00000082613 319 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 2310016D03Rik-201ENSMUST00000190206 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Sectm1a-201ENSMUST00000026162 1692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Gm26658-201ENSMUST00000181067 2500 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Actl9-201ENSMUST00000174088 1373 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Lrrc57-201ENSMUST00000102496 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Cap1-201ENSMUST00000069533 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Gm7052-201ENSMUST00000167568 1512 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Gm15602-201ENSMUST00000116162 465 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Gm11686-201ENSMUST00000122397 333 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 6330418K02Rik-202ENSMUST00000125662 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Gm11493-201ENSMUST00000134567 566 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Plut-201ENSMUST00000172461 855 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Gm26241-201ENSMUST00000174944 101 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Gm23976-201ENSMUST00000175001 101 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Gm22463-201ENSMUST00000175274 101 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Gm22547-201ENSMUST00000175281 101 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Gm22913-201ENSMUST00000175297 101 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Gm23282-201ENSMUST00000175306 101 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Gm25972-201ENSMUST00000175374 101 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Gm22414-201ENSMUST00000175466 101 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Gm26235-201ENSMUST00000175533 101 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Gm25084-201ENSMUST00000175556 101 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Gm24973-201ENSMUST00000175588 101 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Gm23292-201ENSMUST00000175618 101 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Gm23646-201ENSMUST00000178119 101 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Gm24643-201ENSMUST00000178305 101 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Gm24302-201ENSMUST00000178350 101 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Gm26386-201ENSMUST00000178407 101 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Gm25458-201ENSMUST00000178981 101 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Gm22825-201ENSMUST00000179444 101 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Gm8824-201ENSMUST00000182962 990 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Fam162b-201ENSMUST00000020064 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Hs1bp3-201ENSMUST00000020927 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Gm5432-201ENSMUST00000180759 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 AC110091.3-201ENSMUST00000213406 1304 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
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Ccdc18Q640L5 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Gm14828-201ENSMUST00000119381 1155 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
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Ccdc18Q640L5 Larp1b-204ENSMUST00000099121 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 C030014I23Rik-204ENSMUST00000217463 1370 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Gm10406-201ENSMUST00000100895 1813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Gm45728-201ENSMUST00000211475 2979 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Gemin8-202ENSMUST00000087169 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Gm15351-202ENSMUST00000150686 271 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Gm20610-201ENSMUST00000176406 587 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Pttg1-201ENSMUST00000020685 634 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Zfp389-202ENSMUST00000224437 1234 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Olfr403-201ENSMUST00000076675 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Olfr43-201ENSMUST00000078936 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Cbx3-ps5-201ENSMUST00000091545 544 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Cbx3-ps2-201ENSMUST00000099421 544 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Cpvl-201ENSMUST00000166545 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms