Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Gpr19-201ENSMUST00000046255 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Gm14667-201ENSMUST00000119448 1350 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Usp48Q3V0C5 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Pax5-212ENSMUST00000173733 885 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Gm27826-201ENSMUST00000175282 255 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Gm20694-201ENSMUST00000176943 404 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Mir8091-201ENSMUST00000183602 139 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Kif4-ps-202ENSMUST00000185083 652 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 BC025446-202ENSMUST00000185307 758 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Usp48Q3V0C5 CT030195.2-201ENSMUST00000226074 1286 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
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Usp48Q3V0C5 2310016G11Rik-201ENSMUST00000094460 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Fthl17e-201ENSMUST00000096509 841 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Nr4a2-201ENSMUST00000028166 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Usp48Q3V0C5 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Fhl1-202ENSMUST00000114768 1337 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Usp48Q3V0C5 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Usp48Q3V0C5 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
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Usp48Q3V0C5 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
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Usp48Q3V0C5 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Usp48Q3V0C5 Gm12056-201ENSMUST00000148364 1257 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Gm6291-201ENSMUST00000179994 309 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Gm7928-201ENSMUST00000181249 701 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Mrgprb7-ps-201ENSMUST00000190238 964 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Mpzl1-203ENSMUST00000191818 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Gm43564-201ENSMUST00000196185 211 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Gm44777-203ENSMUST00000206930 571 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Gm18256-201ENSMUST00000209087 907 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Gm5650-201ENSMUST00000209641 598 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 AC155266.1-201ENSMUST00000220762 904 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 AC154433.1-201ENSMUST00000224401 1183 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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