Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Gm12849-201ENSMUST00000120013 739 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Gm15373-201ENSMUST00000121495 214 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Gm12688-201ENSMUST00000136525 701 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Gm11365-201ENSMUST00000144277 774 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Chn2-209ENSMUST00000146114 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Gm16013-201ENSMUST00000152249 353 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Gm12847-201ENSMUST00000156219 413 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Platr17-201ENSMUST00000172817 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Gm26750-201ENSMUST00000181718 711 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Gm17514-201ENSMUST00000181863 1102 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Mir6396-201ENSMUST00000183603 111 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Gm19605-205ENSMUST00000221712 677 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Samd11Q1RNF8 Tspan8-202ENSMUST00000080630 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Eef1b2-204ENSMUST00000129339 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Gm37058-201ENSMUST00000193393 1644 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Samd11Q1RNF8 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Oprk1-201ENSMUST00000027038 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Sh3bgrl3-202ENSMUST00000105879 518 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Klra9-202ENSMUST00000112032 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Gm15702-201ENSMUST00000119680 444 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Piga-204ENSMUST00000133813 1086 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Gm16268-201ENSMUST00000159445 1157 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Osgep-207ENSMUST00000162177 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 C430039J16Rik-201ENSMUST00000181148 658 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Gm8162-201ENSMUST00000213951 665 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 AC156633.1-201ENSMUST00000215971 614 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Samd11Q1RNF8 Klra9-201ENSMUST00000071554 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Samd11Q1RNF8 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Dppa3-ps-201ENSMUST00000116499 451 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Gm15476-201ENSMUST00000118247 1191 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Gm14227-201ENSMUST00000119431 629 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Gm45716-201ENSMUST00000124877 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Aamdc-209ENSMUST00000144858 380 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 C330019F10Rik-201ENSMUST00000149428 459 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Gm23479-201ENSMUST00000158876 122 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Gm26610-201ENSMUST00000181529 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Gm8525-201ENSMUST00000189674 861 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
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