Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Fanca-202ENSMUST00000118395 3274 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Rep15-201ENSMUST00000036194 1662 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Trub2-203ENSMUST00000113807 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Gm12950-201ENSMUST00000121683 417 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Gm12688-201ENSMUST00000136525 701 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Gm16441-201ENSMUST00000138176 924 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Gm6038-201ENSMUST00000154310 948 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 1700006J14Rik-204ENSMUST00000161511 574 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Gm4858-201ENSMUST00000179064 735 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Gm38313-201ENSMUST00000191953 1266 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Gm5865-201ENSMUST00000198713 637 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Gm2448-201ENSMUST00000207080 559 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Gm45680-201ENSMUST00000211135 214 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Olfr456-201ENSMUST00000057251 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Nt5dc1-202ENSMUST00000099973 761 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Magea2-202ENSMUST00000112559 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Olfr1156-202ENSMUST00000216191 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Gm12530-201ENSMUST00000152074 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Cap1-201ENSMUST00000069533 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Gm23745-201ENSMUST00000104230 125 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Ube2d-ps-201ENSMUST00000121354 441 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Gm16459-201ENSMUST00000121443 686 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Mocs2-201ENSMUST00000015680 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Tex29-204ENSMUST00000166638 561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Gm27956-201ENSMUST00000175604 260 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Gm27441-201ENSMUST00000185000 105 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 A830092H15Rik-202ENSMUST00000195446 649 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Adh6-ps1-202ENSMUST00000196293 754 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Gm45542-201ENSMUST00000210456 438 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 2310039L15Rik-203ENSMUST00000220058 727 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Olfr225-201ENSMUST00000055276 1260 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Gm9791-201ENSMUST00000060997 447 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Gm42521-201ENSMUST00000199190 2040 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Hectd2os-203ENSMUST00000142067 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Gm5697-201ENSMUST00000122295 2482 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atp2b3Q0VF55 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms