Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
GscQ02591 Cdh1-203ENSMUST00000167688 3203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
GscQ02591 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
GscQ02591 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
GscQ02591 Sfi1-210ENSMUST00000140846 3604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
GscQ02591 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
GscQ02591 4930478P22Rik-203ENSMUST00000202026 2060 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
GscQ02591 Gm26947-201ENSMUST00000182497 2929 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
GscQ02591 Trpv5-202ENSMUST00000193503 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
GscQ02591 Prim1-201ENSMUST00000026461 1583 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
GscQ02591 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
GscQ02591 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
GscQ02591 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
GscQ02591 4631405J19Rik-202ENSMUST00000111270 2909 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
GscQ02591 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
GscQ02591 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
GscQ02591 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
GscQ02591 Cyp51-201ENSMUST00000001507 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
GscQ02591 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
GscQ02591 Tacc2-208ENSMUST00000207549 3492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
GscQ02591 Gpr63-201ENSMUST00000038920 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
GscQ02591 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
GscQ02591 Gm5944-201ENSMUST00000118182 1001 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
GscQ02591 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
GscQ02591 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
GscQ02591 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
GscQ02591 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
GscQ02591 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
GscQ02591 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
GscQ02591 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
GscQ02591 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
GscQ02591 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
GscQ02591 Gm7047-201ENSMUST00000196224 1063 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
GscQ02591 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
GscQ02591 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
GscQ02591 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
GscQ02591 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
GscQ02591 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
GscQ02591 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
GscQ02591 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
GscQ02591 Hcst-201ENSMUST00000075062 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
GscQ02591 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
GscQ02591 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
GscQ02591 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
GscQ02591 Gfap-202ENSMUST00000077902 2600 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
GscQ02591 R3hdm2-218ENSMUST00000170336 3639 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
GscQ02591 Gm37731-201ENSMUST00000194545 2237 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
GscQ02591 Robo4-202ENSMUST00000115046 3878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
GscQ02591 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
GscQ02591 Gm7932-202ENSMUST00000205047 2194 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
GscQ02591 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
GscQ02591 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
GscQ02591 AC123534.1-202ENSMUST00000224256 1837 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
GscQ02591 Cpvl-202ENSMUST00000203101 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
GscQ02591 Zc3hav1-201ENSMUST00000031850 3400 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
GscQ02591 Gm12829-201ENSMUST00000146346 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
GscQ02591 Slc36a2-201ENSMUST00000039305 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
GscQ02591 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
GscQ02591 1700126A01Rik-201ENSMUST00000185283 2061 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
GscQ02591 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
GscQ02591 Ralgps2-203ENSMUST00000171292 3346 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
GscQ02591 Thbs3-202ENSMUST00000119084 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
GscQ02591 Plekha7-207ENSMUST00000182511 4502 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
GscQ02591 Atp6v0a4-201ENSMUST00000040259 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
GscQ02591 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
GscQ02591 Ilf3-203ENSMUST00000213518 3513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
GscQ02591 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
GscQ02591 Gm9866-205ENSMUST00000220998 1973 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
GscQ02591 Vil1-201ENSMUST00000027366 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
GscQ02591 1700019J19Rik-205ENSMUST00000216531 2813 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
GscQ02591 Mrps23-201ENSMUST00000024486 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
GscQ02591 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
GscQ02591 Ssrp1-209ENSMUST00000168266 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
GscQ02591 Ighg3-202ENSMUST00000223179 2414 ntAPPRIS P5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
GscQ02591 Gm23061-201ENSMUST00000102348 116 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
GscQ02591 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
GscQ02591 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
GscQ02591 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
GscQ02591 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
GscQ02591 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
GscQ02591 Scgb2b27-203ENSMUST00000185399 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
GscQ02591 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
GscQ02591 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
GscQ02591 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
GscQ02591 Gm18164-201ENSMUST00000213769 927 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
GscQ02591 Gm18166-201ENSMUST00000215557 927 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
GscQ02591 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
GscQ02591 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
GscQ02591 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
GscQ02591 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
GscQ02591 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
GscQ02591 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
GscQ02591 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
GscQ02591 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
GscQ02591 Eif2s3y-201ENSMUST00000091197 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
GscQ02591 Xpnpep3-201ENSMUST00000041609 3236 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
GscQ02591 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
GscQ02591 Btc-201ENSMUST00000121044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
GscQ02591 Olfr287-204ENSMUST00000170618 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
GscQ02591 Tomm40l-203ENSMUST00000111327 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms