Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Rnf43-202ENSMUST00000092800 4037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Aebp2-201ENSMUST00000032359 5932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Tacc2-203ENSMUST00000084513 9029 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Rnf165-201ENSMUST00000026494 7300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Ctnnd1-207ENSMUST00000111676 5852 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 C2-206ENSMUST00000152417 2157 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Npy1r-201ENSMUST00000039303 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Spns3-201ENSMUST00000021154 1804 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Eif2s3y-201ENSMUST00000091197 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Gm11380-201ENSMUST00000118067 560 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Gm5944-201ENSMUST00000118182 1001 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Pcdhga5-201ENSMUST00000193414 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Gm7880-201ENSMUST00000203748 871 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 4930447C11Rik-201ENSMUST00000204503 928 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 E330021D16Rik-201ENSMUST00000058713 1116 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Il16-203ENSMUST00000145610 3183 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Dock4-204ENSMUST00000220912 7360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Ndufab1-201ENSMUST00000033157 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Polr2a-201ENSMUST00000058470 6740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Erbb4-202ENSMUST00000121473 12037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Sh3gl2-204ENSMUST00000107189 3231 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Tnik-201ENSMUST00000159236 12276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Adar-203ENSMUST00000107405 5871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Gm44510-201ENSMUST00000206288 4532 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Txndc16-205ENSMUST00000139526 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Lama3-201ENSMUST00000092070 10548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Ikbkb-201ENSMUST00000033939 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Gm42499-201ENSMUST00000196193 1412 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Spata31d1a-201ENSMUST00000066510 4261 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Zfhx2-201ENSMUST00000036328 10397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Gm37058-201ENSMUST00000193393 1644 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Dspp-201ENSMUST00000112771 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Hmgcr-201ENSMUST00000022176 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Cenpj-203ENSMUST00000225951 4756 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Lyn-201ENSMUST00000041377 3463 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Slc6a12-209ENSMUST00000171008 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Gsdma3-202ENSMUST00000107508 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 136.2 ms