Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Gm12498-201ENSMUST00000138374 2458 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Gm19951-201ENSMUST00000222616 1328 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Ttc39a-202ENSMUST00000106618 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Myom2-201ENSMUST00000033842 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Eef1b2-204ENSMUST00000129339 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Ighv13-1-201ENSMUST00000103480 294 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Gm6425-201ENSMUST00000136332 790 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Atad3aos-202ENSMUST00000150777 650 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Gm35584-201ENSMUST00000191767 641 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Gm42710-201ENSMUST00000200608 985 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 AC124581.2-201ENSMUST00000225459 282 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 AC102847.1-202ENSMUST00000226313 1245 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 AC154220.1-201ENSMUST00000225033 1705 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Lrrc4-201ENSMUST00000062304 3615 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Gm12097-201ENSMUST00000121523 1414 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Olfr171-202ENSMUST00000205467 1406 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Gm12530-201ENSMUST00000152074 1759 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Zfp704-201ENSMUST00000041124 13834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Gps2-202ENSMUST00000072581 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 AC108416.1-201ENSMUST00000228755 1558 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Cadm2-201ENSMUST00000114292 9564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Morf4l2-213ENSMUST00000166478 1720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Enpp7-201ENSMUST00000092373 1370 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Nek3-204ENSMUST00000178324 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Morf4l2-201ENSMUST00000033797 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Adig-202ENSMUST00000109484 488 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Gsta3-202ENSMUST00000121676 894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Gm45716-201ENSMUST00000124877 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Stk33-205ENSMUST00000141210 949 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Gm6352-201ENSMUST00000203583 1134 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Olfr414-201ENSMUST00000053178 955 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Adig-201ENSMUST00000059889 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms