Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SbdsP70122 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Fcrl1-202ENSMUST00000163661 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SbdsP70122 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SbdsP70122 D030055H07Rik-202ENSMUST00000150953 4325 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Capn3-206ENSMUST00000110721 2898 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Gm6714-201ENSMUST00000218677 2330 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Vma21-201ENSMUST00000114575 4290 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Actn2-201ENSMUST00000064204 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Sipa1l1-210ENSMUST00000222714 6002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Fyn-205ENSMUST00000135242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Dhtkd1-201ENSMUST00000026924 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Fubp1-201ENSMUST00000106121 4525 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Cacna1d-204ENSMUST00000223803 6435 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Ddx25-201ENSMUST00000034612 6934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Gm10827-201ENSMUST00000181897 2586 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Tcf4-203ENSMUST00000114977 3070 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Git2-203ENSMUST00000112183 4886 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Smpd4-218ENSMUST00000170273 2166 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Zfp605-202ENSMUST00000112528 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Rims2-204ENSMUST00000226410 3685 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Fer1l5-202ENSMUST00000179162 6315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Gm15832-201ENSMUST00000146314 1832 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Rnf6-206ENSMUST00000161859 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SbdsP70122 6430562O15Rik-201ENSMUST00000180491 2488 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Smarca1-202ENSMUST00000088973 4798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Wdr60-201ENSMUST00000039349 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Trpm2-203ENSMUST00000105401 7274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Tial1-202ENSMUST00000106226 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Ccdc148-204ENSMUST00000226455 4612 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Gm13660-201ENSMUST00000142828 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SbdsP70122 4930471C04Rik-201ENSMUST00000166038 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Gm35584-201ENSMUST00000191767 641 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
SbdsP70122 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SbdsP70122 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
SbdsP70122 2310039L15Rik-203ENSMUST00000220058 727 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Gm1000-202ENSMUST00000222329 757 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SbdsP70122 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Celf2-224ENSMUST00000182879 2223 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Snhg11-201ENSMUST00000109488 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Ankrd46-201ENSMUST00000057486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Fcgr2b-204ENSMUST00000159969 1578 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Dync1h1-201ENSMUST00000018851 14342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Gab3-202ENSMUST00000114104 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Slc17a8-202ENSMUST00000105295 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Pld5-203ENSMUST00000111167 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Dusp16-201ENSMUST00000100857 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Hmgb2-201ENSMUST00000067925 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SbdsP70122 St3gal6-207ENSMUST00000137035 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Gm16429-202ENSMUST00000201400 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Serpina3g-201ENSMUST00000043315 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Gm7971-201ENSMUST00000086950 1848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Thsd7b-202ENSMUST00000073527 6213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Lrfn5-202ENSMUST00000119481 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Ticam1-201ENSMUST00000058136 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Gm37242-201ENSMUST00000191873 2085 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Gm34923-201ENSMUST00000222673 5043 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Gm19951-201ENSMUST00000222616 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Msrb3-201ENSMUST00000092143 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Dhdds-209ENSMUST00000144668 3219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Ccdc186-202ENSMUST00000118592 6445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Lrrc4-201ENSMUST00000062304 3615 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Vangl1-208ENSMUST00000168312 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Birc6-202ENSMUST00000180037 15768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Pgf-201ENSMUST00000004913 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Slc1a2-202ENSMUST00000080210 11595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SbdsP70122 0610040B10Rik-202ENSMUST00000162890 600 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Park2-203ENSMUST00000168593 735 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Gm19927-201ENSMUST00000185792 781 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms