Protein–RNA interactions for Protein: P50706

Defa8, Alpha-defensin 8 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa8P50706 Krt34-201ENSMUST00000056362 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Pde9a-206ENSMUST00000134525 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa8P50706 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Nipal3-202ENSMUST00000105856 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Fam83c-201ENSMUST00000029143 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Rpl18-207ENSMUST00000210640 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Cacna1c-210ENSMUST00000187474 6911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Gm33914-201ENSMUST00000214108 2150 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Tex21-202ENSMUST00000218426 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa8P50706 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Cd177-201ENSMUST00000063956 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Son-201ENSMUST00000114036 7945 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa8P50706 C920021L13Rik-201ENSMUST00000120398 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Il1f5-206ENSMUST00000168941 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Duoxa1-203ENSMUST00000110538 2467 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Plscr4-201ENSMUST00000034941 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Gm15482-201ENSMUST00000152691 4529 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Bcl2l1-206ENSMUST00000140436 1865 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Arhgap17-203ENSMUST00000167309 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Mitf-202ENSMUST00000043637 4881 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Ccdc87-201ENSMUST00000088653 3163 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Clcn1-201ENSMUST00000031894 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Acsl1-201ENSMUST00000034046 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Gm15604-201ENSMUST00000118350 1456 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Efna5-201ENSMUST00000076840 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Cfap74-204ENSMUST00000123952 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Phf21a-202ENSMUST00000068702 6023 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Slfn3-201ENSMUST00000019130 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa8P50706 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa8P50706 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Adig-202ENSMUST00000109484 488 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Gm16226-204ENSMUST00000162639 423 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Apoa5-205ENSMUST00000215187 495 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa8P50706 AC167364.1-201ENSMUST00000221495 784 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Gm1000-202ENSMUST00000222329 757 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Adig-201ENSMUST00000059889 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Ptpn7-201ENSMUST00000049449 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Cherp-207ENSMUST00000212991 3646 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa8P50706 A930003O13Rik-202ENSMUST00000197486 3098 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Ncor2-201ENSMUST00000055256 7780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Klhl7-202ENSMUST00000163409 2857 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Tmem255a-201ENSMUST00000066498 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Prnd-201ENSMUST00000110169 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Thbs3-202ENSMUST00000119084 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Gm38312-201ENSMUST00000195426 1746 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Eci2-201ENSMUST00000021854 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Sh3glb1-204ENSMUST00000199531 2584 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Ehmt1-210ENSMUST00000147147 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Gm42031-201ENSMUST00000209823 1885 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Gm21874-202ENSMUST00000190315 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Gpm6b-201ENSMUST00000060210 2858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Bbs9-209ENSMUST00000147405 3045 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Slc6a12-209ENSMUST00000171008 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Gm7967-202ENSMUST00000191042 5042 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Stard13-201ENSMUST00000062015 5526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Cptp-201ENSMUST00000030950 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa8P50706 5330439K02Rik-201ENSMUST00000180953 2312 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Pms2-209ENSMUST00000148011 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Prdm10-204ENSMUST00000215499 6772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Cd160-203ENSMUST00000165991 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Upp2-201ENSMUST00000059102 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Xrcc6-201ENSMUST00000069530 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Taf3-204ENSMUST00000114909 4897 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Odf2-205ENSMUST00000113757 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Trpm2-203ENSMUST00000105401 7274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Fam171a1-202ENSMUST00000072955 3364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Rangap1-203ENSMUST00000171115 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa8P50706 5730419F03Rik-201ENSMUST00000190504 2092 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa8P50706 AU022252-203ENSMUST00000141112 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Lypla1-202ENSMUST00000115529 930 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Gm15285-201ENSMUST00000119271 473 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Gm11988-201ENSMUST00000122321 1069 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Gm35584-201ENSMUST00000191767 641 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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