Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Gm42619-201ENSMUST00000197564 1136 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Gm19269-201ENSMUST00000211401 804 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Gm7904-201ENSMUST00000217049 465 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
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PtpreP49446 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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PtpreP49446 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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PtpreP49446 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PtpreP49446 4930579F01Rik-202ENSMUST00000199293 1598 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
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PtpreP49446 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
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PtpreP49446 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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PtpreP49446 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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PtpreP49446 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtpreP49446 2610524H06Rik-201ENSMUST00000100850 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Sfi1-204ENSMUST00000118627 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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PtpreP49446 Hoxd3os1-203ENSMUST00000145799 511 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Tnnt1-206ENSMUST00000163710 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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PtpreP49446 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Ebi3-201ENSMUST00000003274 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Tbc1d21-201ENSMUST00000040217 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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PtpreP49446 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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PtpreP49446 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Hbp1-206ENSMUST00000176103 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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PtpreP49446 Skint7-202ENSMUST00000106568 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Bglap3-203ENSMUST00000107543 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Lime1-202ENSMUST00000108804 960 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Tmsb15b1-201ENSMUST00000113071 439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtpreP49446 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Gm6441-201ENSMUST00000120983 696 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Gm13031-201ENSMUST00000140501 924 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Gm23582-201ENSMUST00000158530 139 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Pitpnm2os2-201ENSMUST00000159053 828 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Tcl1-203ENSMUST00000175652 535 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtpreP49446 1700015G11Rik-202ENSMUST00000185758 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Gm34701-201ENSMUST00000204213 849 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtpreP49446 AC241616.1-201ENSMUST00000213741 166 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Rps2-ps12-201ENSMUST00000214262 785 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Gm17611-202ENSMUST00000220613 814 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
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