Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Mettl8-201ENSMUST00000090849 1842 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Prim2-201ENSMUST00000027312 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Nampt-201ENSMUST00000020886 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Phf20-ps-201ENSMUST00000185066 2886 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
SrprbP47758 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Gm11735-201ENSMUST00000106377 1581 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Smok2b-201ENSMUST00000059824 1584 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Cep112-201ENSMUST00000061287 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Lypla1-203ENSMUST00000119612 529 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Gm16217-201ENSMUST00000124182 616 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SrprbP47758 7330404K18Rik-201ENSMUST00000125558 487 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Lrrc75aos2-202ENSMUST00000128647 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Gm16288-201ENSMUST00000137940 367 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
SrprbP47758 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Gm26208-201ENSMUST00000158677 124 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Gm37390-201ENSMUST00000192452 872 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Exoc7-202ENSMUST00000106411 3205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Gm27177-201ENSMUST00000183339 2946 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Tmem67-202ENSMUST00000108293 3945 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Msh3-202ENSMUST00000185852 3946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Pou2f1-204ENSMUST00000111426 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SrprbP47758 4932438H23Rik-201ENSMUST00000035689 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Orc4-201ENSMUST00000028098 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SrprbP47758 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Aplp2-202ENSMUST00000079758 3504 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Gm15965-201ENSMUST00000123318 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Oprm1-204ENSMUST00000063036 1427 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Capn3-206ENSMUST00000110721 2898 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Anxa7-201ENSMUST00000065504 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Prkd3-204ENSMUST00000119284 4743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Micalcl-203ENSMUST00000106645 2309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Gpr143-201ENSMUST00000026383 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
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SrprbP47758 2410002F23Rik-220ENSMUST00000191537 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
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SrprbP47758 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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SrprbP47758 Pvalb-201ENSMUST00000005860 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Taar5-201ENSMUST00000092659 1014 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Olfr95-201ENSMUST00000060728 5129 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Ncam1-201ENSMUST00000114476 2567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Txk-203ENSMUST00000197313 2190 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SrprbP47758 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SrprbP47758 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Cd177-201ENSMUST00000063956 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Ankrd36-201ENSMUST00000109855 1363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SrprbP47758 4933422A05Rik-201ENSMUST00000213706 1356 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Scnn1g-201ENSMUST00000000221 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Ticam1-201ENSMUST00000058136 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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