Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

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Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Crip1-201ENSMUST00000006523 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprkP35822 H2-T3-204ENSMUST00000102675 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Syna-201ENSMUST00000149604 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Slc7a9-203ENSMUST00000118969 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprkP35822 H2-M10.4-201ENSMUST00000057502 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Gm2492-201ENSMUST00000221355 1394 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Gm12011-201ENSMUST00000119734 618 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Cfap100-202ENSMUST00000127508 417 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Gm20186-203ENSMUST00000202542 741 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Gm44700-201ENSMUST00000208228 846 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Gm6129-201ENSMUST00000220725 801 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Gm8256-202ENSMUST00000227964 828 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Htr1b-201ENSMUST00000051005 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprkP35822 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Mx1-202ENSMUST00000113768 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Ly6e-202ENSMUST00000169343 2154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Pgbd5-206ENSMUST00000172566 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Gm24471-201ENSMUST00000104485 131 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Odam-201ENSMUST00000113274 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Gm13543-201ENSMUST00000121230 796 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Gm28065-201ENSMUST00000185290 833 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Gm7565-201ENSMUST00000203611 623 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprkP35822 4933439N14Rik-201ENSMUST00000211062 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Calb2-202ENSMUST00000212297 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprkP35822 AC153948.2-201ENSMUST00000218112 505 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Gm32296-201ENSMUST00000220590 1057 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprkP35822 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Gm16429-202ENSMUST00000201400 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Gm7971-201ENSMUST00000086950 1848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Slc17a3-203ENSMUST00000110422 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprkP35822 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Gm39464-201ENSMUST00000214091 2169 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Ncmap-203ENSMUST00000105858 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprkP35822 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Apoo-201ENSMUST00000113895 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Atp5h-208ENSMUST00000180072 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Gm16973-201ENSMUST00000180682 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Ackr1-202ENSMUST00000194046 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Cryab-206ENSMUST00000217475 1117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Cst13-201ENSMUST00000046589 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Gm10250-201ENSMUST00000090488 482 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Cyp2d9-201ENSMUST00000089129 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Toe1-201ENSMUST00000030451 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Grb2-204ENSMUST00000106499 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Gm44167-201ENSMUST00000204957 1878 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Exoc7-201ENSMUST00000021147 3337 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Gm15383-201ENSMUST00000121889 1443 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Gm42467-201ENSMUST00000202954 1447 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Hmg20a-205ENSMUST00000215269 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Trp63-207ENSMUST00000115308 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Cdcp2-201ENSMUST00000062495 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprkP35822 5330411J11Rik-201ENSMUST00000137162 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Ighv8-6-201ENSMUST00000103524 301 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Gm11652-201ENSMUST00000117842 1267 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Gm18859-201ENSMUST00000118792 825 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Gm11824-201ENSMUST00000120191 846 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
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