Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm5210-201ENSMUST00000182150 1010 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
RxraP28700 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
RxraP28700 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
RxraP28700 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
RxraP28700 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RxraP28700 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RxraP28700 Gm7047-201ENSMUST00000196224 1063 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
RxraP28700 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RxraP28700 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
RxraP28700 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
RxraP28700 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
RxraP28700 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
RxraP28700 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RxraP28700 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RxraP28700 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RxraP28700 Mei4-203ENSMUST00000189832 2578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RxraP28700 Gm17980-201ENSMUST00000217977 2349 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
RxraP28700 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RxraP28700 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RxraP28700 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RxraP28700 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RxraP28700 F730016J06Rik-201ENSMUST00000126140 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RxraP28700 Stau2-202ENSMUST00000054668 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RxraP28700 Gm42031-201ENSMUST00000209823 1885 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RxraP28700 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RxraP28700 4632411P08Rik-201ENSMUST00000181005 3237 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RxraP28700 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RxraP28700 Zfp775-201ENSMUST00000061720 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RxraP28700 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
RxraP28700 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RxraP28700 Olfr222-202ENSMUST00000214351 2474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RxraP28700 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RxraP28700 Hsdl1-204ENSMUST00000212517 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RxraP28700 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RxraP28700 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RxraP28700 C330027C09Rik-201ENSMUST00000048374 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RxraP28700 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RxraP28700 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RxraP28700 9530026P05Rik-204ENSMUST00000204449 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RxraP28700 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RxraP28700 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RxraP28700 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RxraP28700 Gm12367-202ENSMUST00000146909 2105 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RxraP28700 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RxraP28700 Bicd1-203ENSMUST00000111513 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RxraP28700 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RxraP28700 Ptbp3-201ENSMUST00000030076 6855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RxraP28700 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
RxraP28700 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RxraP28700 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RxraP28700 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RxraP28700 6820431F20Rik-201ENSMUST00000150051 936 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
RxraP28700 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RxraP28700 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RxraP28700 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RxraP28700 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
RxraP28700 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
RxraP28700 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
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RxraP28700 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
RxraP28700 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RxraP28700 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RxraP28700 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RxraP28700 Rps24-210ENSMUST00000225023 1613 ntAPPRIS P4 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RxraP28700 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RxraP28700 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RxraP28700 Tceal8-204ENSMUST00000163584 2358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RxraP28700 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RxraP28700 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RxraP28700 AC156631.1-201ENSMUST00000215213 1358 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RxraP28700 Gm7598-201ENSMUST00000130251 3123 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RxraP28700 AC115891.3-201ENSMUST00000219161 2472 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
RxraP28700 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RxraP28700 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RxraP28700 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RxraP28700 Fanca-202ENSMUST00000118395 3274 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RxraP28700 Myc-206ENSMUST00000167731 1821 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RxraP28700 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RxraP28700 Spns3-201ENSMUST00000021154 1804 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RxraP28700 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RxraP28700 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RxraP28700 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RxraP28700 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RxraP28700 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RxraP28700 Atxn2l-206ENSMUST00000206577 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RxraP28700 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RxraP28700 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RxraP28700 Phtf1os-201ENSMUST00000160110 4046 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
RxraP28700 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RxraP28700 Slc6a12-209ENSMUST00000171008 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RxraP28700 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RxraP28700 Myo1c-203ENSMUST00000102505 4652 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RxraP28700 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RxraP28700 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RxraP28700 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
RxraP28700 Rapgef4os2-201ENSMUST00000128165 2116 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RxraP28700 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RxraP28700 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RxraP28700 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RxraP28700 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
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