Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Ighv1-5-201ENSMUST00000103494 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Tnnt3-213ENSMUST00000105952 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Tnnt3-215ENSMUST00000105954 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Tnnt3-216ENSMUST00000105955 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Tnnt3-218ENSMUST00000105958 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Kyat1-203ENSMUST00000113660 1388 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Gm14231-201ENSMUST00000120090 592 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Gm6783-201ENSMUST00000120916 1437 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 1700112K13Rik-201ENSMUST00000141892 701 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Gm11670-201ENSMUST00000143435 511 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Ttc39b-206ENSMUST00000148811 727 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Gm5860-202ENSMUST00000151038 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Ccr6-202ENSMUST00000164411 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Gm6047-201ENSMUST00000167221 574 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Tnnt3-225ENSMUST00000179658 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 1500015A07Rik-202ENSMUST00000184530 423 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Gm29595-202ENSMUST00000187954 466 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Gm37517-201ENSMUST00000194004 1289 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Gm37944-201ENSMUST00000194233 414 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Gm42689-201ENSMUST00000202403 404 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Gm44155-201ENSMUST00000203923 412 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 3930402G23Rik-202ENSMUST00000208615 581 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Gm9619-201ENSMUST00000211587 762 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 AC132104.1-201ENSMUST00000213615 260 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 AC153379.1-201ENSMUST00000218174 485 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 AC140314.1-201ENSMUST00000219549 554 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 9430031K09Rik-201ENSMUST00000222913 925 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 4931423N10Rik-201ENSMUST00000028113 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Olfr414-201ENSMUST00000053178 955 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Tnnt3-202ENSMUST00000078497 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Mcemp1-201ENSMUST00000014118 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Mymk-201ENSMUST00000009358 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Tpm1-205ENSMUST00000113685 1208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Cav2-203ENSMUST00000115462 694 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Gm7113-201ENSMUST00000120477 958 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Gm14006-201ENSMUST00000122132 981 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Gm11233-201ENSMUST00000122357 634 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Gm12000-201ENSMUST00000132007 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Gm13267-202ENSMUST00000150099 281 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Stamos-201ENSMUST00000152524 801 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Gm3760-201ENSMUST00000167475 804 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Prl3c1-203ENSMUST00000178072 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Mir6359-201ENSMUST00000183668 81 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Psmb6-ps2-201ENSMUST00000187074 705 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Nabp1-206ENSMUST00000188051 680 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Trbv27-201ENSMUST00000193711 277 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
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Hoxd8P23463 Gm43821-201ENSMUST00000199198 729 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Gm44304-201ENSMUST00000200509 145 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Gm20186-201ENSMUST00000201775 737 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Gm43997-201ENSMUST00000203986 1005 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Olfr1315-ps1-201ENSMUST00000207542 1230 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Eif3k-204ENSMUST00000208616 909 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Tmem238l-203ENSMUST00000211300 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Gm26861-207ENSMUST00000223253 1095 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 AC133496.1-201ENSMUST00000223891 743 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 AC154759.1-201ENSMUST00000224137 1159 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 AC154683.1-201ENSMUST00000228409 1284 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Nup43-201ENSMUST00000040135 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Hcst-201ENSMUST00000075062 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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