Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Olfr456-201ENSMUST00000057251 1052 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Prdm16-205ENSMUST00000105637 8595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Prdm16-201ENSMUST00000030902 8598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Pgbd5-206ENSMUST00000172566 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Cdcp2-201ENSMUST00000062495 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Gm44888-201ENSMUST00000209119 2541 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Atxn2l-206ENSMUST00000206577 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Gtf2ird1-206ENSMUST00000111244 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Pcdhgc5-201ENSMUST00000055935 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 AC124561.1-202ENSMUST00000228652 1929 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Hcar2-201ENSMUST00000057145 1930 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Hist4h4-201ENSMUST00000179285 2863 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Gbp3-201ENSMUST00000029935 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Aoc1-201ENSMUST00000031835 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Trim34a-201ENSMUST00000060315 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Brpf1-208ENSMUST00000203577 4468 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Zmynd8-221ENSMUST00000177633 5093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Vwce-201ENSMUST00000055115 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Cacna2d1-204ENSMUST00000115281 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 AC126459.1-201ENSMUST00000214791 2123 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Pold1-201ENSMUST00000049343 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Cfap74-204ENSMUST00000123952 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Ifih1-201ENSMUST00000028259 5470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Omt2b-203ENSMUST00000187667 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Mrgprx3-ps-201ENSMUST00000187741 918 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Olfr963-201ENSMUST00000073433 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Tmprss11c-201ENSMUST00000059424 1615 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Synpo2l-203ENSMUST00000119483 3696 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Zfyve1-201ENSMUST00000048319 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Dhcr7-211ENSMUST00000207143 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Mllt3-201ENSMUST00000078090 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Zfp418-201ENSMUST00000051435 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Clip1-203ENSMUST00000111561 5883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Rpap2-201ENSMUST00000065422 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Nrros-204ENSMUST00000126869 2540 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Gm37909-201ENSMUST00000193157 2159 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 AI606181-201ENSMUST00000099454 2796 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Htr3b-201ENSMUST00000008734 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Gm26822-201ENSMUST00000181732 3374 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Bco1-201ENSMUST00000034308 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Lrrc61-202ENSMUST00000114545 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 CT025639.2-202ENSMUST00000225298 1630 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Gzmn-201ENSMUST00000015587 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Gm8918-201ENSMUST00000190587 1087 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 4930517L18Rik-201ENSMUST00000191880 482 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Gm37020-201ENSMUST00000195303 992 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Gm42833-201ENSMUST00000196019 2124 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Gcc1-201ENSMUST00000064377 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Atp6v0e2-201ENSMUST00000040361 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
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