Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Gm28624-201ENSMUST00000186430 2131 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 C130021I20Rik-201ENSMUST00000147294 3693 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Uspl1-202ENSMUST00000100410 3148 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Pax6-207ENSMUST00000111087 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Traip-201ENSMUST00000049348 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Znrf1-202ENSMUST00000166859 3650 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Gm12224-201ENSMUST00000124047 567 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Gm13802-201ENSMUST00000150159 663 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Gm17606-201ENSMUST00000169818 234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Gm26272-201ENSMUST00000179241 132 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 4732414G09Rik-202ENSMUST00000180695 408 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 4933417D19Rik-201ENSMUST00000181432 1229 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Gm5267-201ENSMUST00000191574 1045 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Chordc1-202ENSMUST00000213605 519 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Btg4-203ENSMUST00000213680 1282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Krtap12-1-201ENSMUST00000092370 656 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Pklr-201ENSMUST00000047111 2787 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Arih2-201ENSMUST00000013338 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Ccdc62-202ENSMUST00000165148 3920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Gm45699-201ENSMUST00000212838 1576 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Gm10643-201ENSMUST00000098592 1577 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Gab3-202ENSMUST00000114104 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Hmgcll1-201ENSMUST00000008052 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Gm44888-201ENSMUST00000209119 2541 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Gm11380-201ENSMUST00000118067 560 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Gm11957-201ENSMUST00000118304 779 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Gm16217-201ENSMUST00000124182 616 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Gm14255-201ENSMUST00000128846 248 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Dhdds-209ENSMUST00000144668 3219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Morf4l2-213ENSMUST00000166478 1720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Sgk3-204ENSMUST00000171265 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Mir8091-201ENSMUST00000183602 139 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Gm31520-203ENSMUST00000204874 647 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Rp9-204ENSMUST00000216973 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 AC162932.1-201ENSMUST00000219209 872 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Gm32939-201ENSMUST00000222336 843 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Gm14005-210ENSMUST00000225087 1413 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 AC102847.1-202ENSMUST00000226313 1245 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Adgre5-202ENSMUST00000075843 3000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Slc22a14-204ENSMUST00000170400 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Ampd2-203ENSMUST00000102638 3650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.7 ms