Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Hjurp-201ENSMUST00000054674 4878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Gm45719-201ENSMUST00000207954 1662 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 AC107763.1-201ENSMUST00000226082 1365 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Mir1941-201ENSMUST00000157834 83 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Gm28356-201ENSMUST00000186941 927 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Tcstv1-202ENSMUST00000190512 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Ndufc1-204ENSMUST00000193279 315 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Gm31314-201ENSMUST00000201435 609 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Clec2h-202ENSMUST00000204416 386 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Gm32786-201ENSMUST00000211351 628 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 AC154585.1-201ENSMUST00000218917 997 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 CT009713.2-201ENSMUST00000225532 1149 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 AC133517.1-201ENSMUST00000225825 594 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Tnfrsf18-201ENSMUST00000040274 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Klk1b24-201ENSMUST00000073713 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Gm22341-201ENSMUST00000083775 129 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Klk1b21-201ENSMUST00000085455 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Rps8-ps4-201ENSMUST00000092523 612 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Ms4a6b-201ENSMUST00000025580 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Tstd2-201ENSMUST00000107770 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Lrrc4-201ENSMUST00000062304 3615 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Exosc9-201ENSMUST00000029269 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Oprm1-211ENSMUST00000105602 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Epha6-203ENSMUST00000161358 1356 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Gm6880A3KG45 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Slc6a12-209ENSMUST00000171008 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Hist1h4i-201ENSMUST00000102977 727 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Gm12009-201ENSMUST00000121361 1100 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Stk33-205ENSMUST00000141210 949 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Gm4778-202ENSMUST00000159517 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Tnnt1-206ENSMUST00000163710 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Park2-203ENSMUST00000168593 735 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Gm3115-202ENSMUST00000177660 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Gm6337-203ENSMUST00000177662 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Gm3727-202ENSMUST00000178251 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Psmb6-ps2-201ENSMUST00000187074 705 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Gm43726-201ENSMUST00000199110 775 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Gm42710-201ENSMUST00000200608 985 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 AC153379.1-201ENSMUST00000218174 485 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 AC122840.4-201ENSMUST00000221310 1285 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Mrps18b-201ENSMUST00000025305 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Ggta1-201ENSMUST00000044255 1221 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Rpl9-201ENSMUST00000057885 738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Tas2r135-201ENSMUST00000070178 1093 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Rps3a3-201ENSMUST00000074680 795 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Gm8730-201ENSMUST00000076373 954 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Gm5148-201ENSMUST00000079755 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Olfr553-201ENSMUST00000098222 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Mrgpra1-201ENSMUST00000098438 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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