Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atp8b5A3FIN4 AC122293.1-201ENSMUST00000218333 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atp8b5A3FIN4 Gm45501-201ENSMUST00000211468 2526 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Atp8b5A3FIN4 4932430I15Rik-201ENSMUST00000180431 3306 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atp8b5A3FIN4 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atp8b5A3FIN4 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atp8b5A3FIN4 Papss1-206ENSMUST00000200527 2811 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atp8b5A3FIN4 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atp8b5A3FIN4 Hs1bp3-201ENSMUST00000020927 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atp8b5A3FIN4 Setmar-201ENSMUST00000049246 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atp8b5A3FIN4 Snx29-201ENSMUST00000096273 1622 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atp8b5A3FIN4 Smok3a-202ENSMUST00000171498 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atp8b5A3FIN4 Pcdhb10-201ENSMUST00000051126 2851 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atp8b5A3FIN4 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atp8b5A3FIN4 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atp8b5A3FIN4 Rxfp2-202ENSMUST00000110496 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atp8b5A3FIN4 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atp8b5A3FIN4 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atp8b5A3FIN4 Pcdh15-229ENSMUST00000155701 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atp8b5A3FIN4 Hsdl1-204ENSMUST00000212517 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atp8b5A3FIN4 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atp8b5A3FIN4 Camk2b-210ENSMUST00000109815 3780 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atp8b5A3FIN4 4932438H23Rik-201ENSMUST00000035689 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atp8b5A3FIN4 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atp8b5A3FIN4 Cdip1-202ENSMUST00000117713 1964 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atp8b5A3FIN4 Nek3-204ENSMUST00000178324 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atp8b5A3FIN4 Rabgef1-201ENSMUST00000026390 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atp8b5A3FIN4 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Atp8b5A3FIN4 Gm5764-201ENSMUST00000118817 885 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
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Atp8b5A3FIN4 Gm13817-201ENSMUST00000142249 604 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atp8b5A3FIN4 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atp8b5A3FIN4 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atp8b5A3FIN4 Gm7583-201ENSMUST00000182941 1005 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Atp8b5A3FIN4 Fgfbp1-203ENSMUST00000199894 1228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atp8b5A3FIN4 Gm5881-201ENSMUST00000204737 367 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Atp8b5A3FIN4 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Atp8b5A3FIN4 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atp8b5A3FIN4 Atp6v0a4-201ENSMUST00000040259 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atp8b5A3FIN4 Ahrr-202ENSMUST00000109640 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atp8b5A3FIN4 Exoc3l4-210ENSMUST00000223050 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atp8b5A3FIN4 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atp8b5A3FIN4 Gm43737-201ENSMUST00000199915 2740 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Atp8b5A3FIN4 Hsd3b1-202ENSMUST00000107016 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atp8b5A3FIN4 Gm13498-201ENSMUST00000119159 2166 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Atp8b5A3FIN4 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Atp8b5A3FIN4 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atp8b5A3FIN4 Toe1-201ENSMUST00000030451 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atp8b5A3FIN4 Lin54-210ENSMUST00000154921 3734 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atp8b5A3FIN4 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atp8b5A3FIN4 Fam13c-203ENSMUST00000173042 3310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atp8b5A3FIN4 Elmo3-201ENSMUST00000109375 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atp8b5A3FIN4 Kif2a-206ENSMUST00000159772 2570 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Atp8b5A3FIN4 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Atp8b5A3FIN4 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atp8b5A3FIN4 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Atp8b5A3FIN4 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Atp8b5A3FIN4 Gsta3-202ENSMUST00000121676 894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Atp8b5A3FIN4 1700001J04Rik-202ENSMUST00000154037 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atp8b5A3FIN4 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atp8b5A3FIN4 Gm20443-201ENSMUST00000173840 735 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Atp8b5A3FIN4 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Atp8b5A3FIN4 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atp8b5A3FIN4 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atp8b5A3FIN4 Ptk2b-203ENSMUST00000111121 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atp8b5A3FIN4 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atp8b5A3FIN4 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atp8b5A3FIN4 Zfp111-202ENSMUST00000073833 3079 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atp8b5A3FIN4 Zfp7-201ENSMUST00000023179 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atp8b5A3FIN4 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atp8b5A3FIN4 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atp8b5A3FIN4 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atp8b5A3FIN4 Sun1-201ENSMUST00000058716 4134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atp8b5A3FIN4 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atp8b5A3FIN4 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atp8b5A3FIN4 Slfn3-201ENSMUST00000019130 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atp8b5A3FIN4 A1bg-201ENSMUST00000096418 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atp8b5A3FIN4 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atp8b5A3FIN4 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atp8b5A3FIN4 Trp63-207ENSMUST00000115308 2380 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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