Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 AC156016.4-201ENSMUST00000227470 647 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 C330021F23Rik-202ENSMUST00000136592 1621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Col5a3Q9JLI2 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 AC154575.1-201ENSMUST00000227166 1474 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 AC242690.1-202ENSMUST00000214616 1742 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Col5a3Q9JLI2 Gm24471-201ENSMUST00000104485 131 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
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Col5a3Q9JLI2 Apoc2-203ENSMUST00000142352 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm23555-201ENSMUST00000157815 135 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Pdc-201ENSMUST00000165062 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm6463-201ENSMUST00000182090 966 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Rwdd2a-203ENSMUST00000185566 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Ighv5-1-201ENSMUST00000193324 353 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 AC157931.1-201ENSMUST00000198565 346 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm3635-201ENSMUST00000212314 354 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Fam71e2-202ENSMUST00000174409 2716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Col5a3Q9JLI2 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Sncaip-201ENSMUST00000025413 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Loxl3-202ENSMUST00000101257 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Col5a3Q9JLI2 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Olfr1511-202ENSMUST00000214168 1468 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Col5a3Q9JLI2 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Col5a3Q9JLI2 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Col5a3Q9JLI2 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Ces1e-203ENSMUST00000176282 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Col5a3Q9JLI2 Cyp2e1-203ENSMUST00000210235 1012 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Col5a3Q9JLI2 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Col5a3Q9JLI2 Rad52-212ENSMUST00000162461 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Col5a3Q9JLI2 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Chrne-202ENSMUST00000102556 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Slc31a2-202ENSMUST00000107467 868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Igsf5-204ENSMUST00000113795 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Gm6881-201ENSMUST00000121811 833 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Gm15579-201ENSMUST00000141299 757 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Gm15664-201ENSMUST00000160167 184 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Gm9866-201ENSMUST00000177636 486 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Gm37976-201ENSMUST00000193827 345 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Gm31378-201ENSMUST00000213538 267 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Gm35298-201ENSMUST00000222719 430 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 AC140393.4-201ENSMUST00000226994 765 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Npy-201ENSMUST00000031843 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Clec1b-201ENSMUST00000032262 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 A830005F24Rik-201ENSMUST00000065465 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Zfp640-201ENSMUST00000071320 894 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms