Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

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Length 287 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 Gm11824-201ENSMUST00000120191 846 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 Syngr4-202ENSMUST00000120299 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 Gm16547-201ENSMUST00000159474 293 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 Gm24328-201ENSMUST00000175104 67 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 Gm29346-201ENSMUST00000188147 255 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 Gm29669-201ENSMUST00000188605 881 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 Gm4430-202ENSMUST00000193902 1041 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 Gm37362-201ENSMUST00000194567 634 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 Tmem238l-203ENSMUST00000211300 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 Gm32296-201ENSMUST00000220590 1057 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 Gm14005-210ENSMUST00000225087 1413 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 Gm15604-201ENSMUST00000118350 1456 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 Gpr19-201ENSMUST00000046255 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 Micalcl-203ENSMUST00000106645 2309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 Ankrd36-201ENSMUST00000109855 1363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 Myc-208ENSMUST00000191178 1362 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 Slc16a7-202ENSMUST00000105257 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 Mir291b-201ENSMUST00000104838 79 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 Camk2a-204ENSMUST00000115295 979 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 Ifitm7-201ENSMUST00000117803 853 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 Rpl17-ps1-201ENSMUST00000119156 552 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 Gm15136-201ENSMUST00000120552 533 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 Gm15196-201ENSMUST00000121406 482 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 Gm13783-201ENSMUST00000131634 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 Ccr6-204ENSMUST00000167956 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 Gm37390-201ENSMUST00000192452 872 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 Gm37723-201ENSMUST00000194480 565 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 Gm43564-201ENSMUST00000196185 211 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 Fcer2a-205ENSMUST00000208145 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 E230034D01Rik-203ENSMUST00000217357 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 AC154407.1-201ENSMUST00000226777 526 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 AC161172.1-201ENSMUST00000227801 486 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 AC164883.7-201ENSMUST00000228534 851 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 Tctex1d1-201ENSMUST00000030248 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 2010001K21Rik-201ENSMUST00000060680 519 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 Atf7-201ENSMUST00000096143 390 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 4631405J19Rik-201ENSMUST00000099699 1225 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 Spert-201ENSMUST00000035243 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 Pcdhb9-201ENSMUST00000057228 3055 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 Gm13169-201ENSMUST00000122090 1459 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 Gm26908-201ENSMUST00000181856 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 AC151836.1-201ENSMUST00000228730 1637 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 Cenpo-202ENSMUST00000111169 1550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 Mkrn2os-202ENSMUST00000112957 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 Ptpa-210ENSMUST00000136009 810 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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