Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Gm37944-201ENSMUST00000194233 414 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Gm21149-201ENSMUST00000197995 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Gm44388-201ENSMUST00000204350 258 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Gm5738-201ENSMUST00000206016 779 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 CT030035.1-201ENSMUST00000223964 935 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Gm9531-201ENSMUST00000055820 638 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Ifne-201ENSMUST00000056014 664 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Tdpoz4-201ENSMUST00000075953 1113 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Cd300c2-201ENSMUST00000092464 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Efna1-203ENSMUST00000118860 1403 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Rffl-201ENSMUST00000021036 1719 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Ighv7-1-201ENSMUST00000103474 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Tpm1-205ENSMUST00000113685 1208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Gm6612-201ENSMUST00000170777 395 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Gm4812-201ENSMUST00000182847 993 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Gm28179-201ENSMUST00000188365 613 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Gm28079-206ENSMUST00000188554 1170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Marc1-203ENSMUST00000189492 1239 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Gm7539-201ENSMUST00000189789 630 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Gm42780-201ENSMUST00000197083 734 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 AC124613.1-201ENSMUST00000198711 88 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Gm45893-201ENSMUST00000211899 247 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 AC155300.1-201ENSMUST00000219134 480 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Olfr1417-201ENSMUST00000061235 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Rps8-ps4-201ENSMUST00000092523 612 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 A1cf-204ENSMUST00000224564 1432 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Nr1h4-201ENSMUST00000058126 1964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Atcayos-203ENSMUST00000150782 3057 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Gm1661-201ENSMUST00000077500 1422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Ifna9-201ENSMUST00000102807 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Gm11736-201ENSMUST00000121468 505 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Rab7b-205ENSMUST00000136247 497 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Gng2-203ENSMUST00000159073 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Rhoc-205ENSMUST00000196817 877 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Gm44017-201ENSMUST00000203231 740 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 AC163638.2-201ENSMUST00000224920 827 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Tbata-202ENSMUST00000079235 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Tmprss11c-201ENSMUST00000059424 1615 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Galntl5-202ENSMUST00000114965 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Als2cr12-206ENSMUST00000191565 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Nxpe1-ps-201ENSMUST00000209981 1454 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Med24-202ENSMUST00000100500 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Eif2ak4-203ENSMUST00000110869 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Gm5174-201ENSMUST00000171131 1423 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Gm39464-201ENSMUST00000214091 2169 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Mir181d-201ENSMUST00000102383 72 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Ccdc42-202ENSMUST00000102612 785 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Stmn3-201ENSMUST00000103045 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Olfr1060-ps1-201ENSMUST00000118335 943 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 1700064H15Rik-201ENSMUST00000119133 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Gm29346-201ENSMUST00000188147 255 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Cpsf4l-201ENSMUST00000018871 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Gm37872-201ENSMUST00000192362 886 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Gm8625-201ENSMUST00000194185 1077 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
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