Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Olfr1219-204ENSMUST00000215225 5865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Slc25a44-204ENSMUST00000195657 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Tsc1-204ENSMUST00000113870 7595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Sgk3-203ENSMUST00000168907 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Ralgps1-201ENSMUST00000042615 6029 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Tbcel-203ENSMUST00000125995 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Acad10-201ENSMUST00000031412 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Acad10-202ENSMUST00000111770 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Nfkbiz-201ENSMUST00000036273 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 R3hdm2-205ENSMUST00000105251 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Ces1c-201ENSMUST00000034189 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Mcc-201ENSMUST00000089874 7858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Ctnnd1-202ENSMUST00000066177 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Zfp804b-202ENSMUST00000200317 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Idua-201ENSMUST00000071650 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Klhl7-202ENSMUST00000163409 2857 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Actn1-202ENSMUST00000167327 2664 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Plxdc2-201ENSMUST00000028081 6947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Thsd7b-201ENSMUST00000040311 3895 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Gm13497-201ENSMUST00000139497 2038 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Phf8-203ENSMUST00000112662 3732 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Elovl5-201ENSMUST00000034904 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Gm45769-201ENSMUST00000204588 1828 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc33-204ENSMUST00000119665 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 F730016J06Rik-203ENSMUST00000156508 2593 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Zfp111-202ENSMUST00000073833 3079 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Clec14a-201ENSMUST00000062254 4571 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Gm20796-201ENSMUST00000180355 5838 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Rgs8-202ENSMUST00000111810 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Usp45-201ENSMUST00000040429 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Nlgn3-201ENSMUST00000065858 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Kif3a-202ENSMUST00000118353 2178 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Myo9a-206ENSMUST00000136740 12252 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Trem1-201ENSMUST00000048782 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Slc25a45-201ENSMUST00000025732 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Slc7a3-203ENSMUST00000113710 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Gm38123-201ENSMUST00000194990 2779 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Thsd7b-202ENSMUST00000073527 6213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Suclg2-204ENSMUST00000204224 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Apobec1-203ENSMUST00000112587 2072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Med12l-206ENSMUST00000199659 11006 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Mcm5-205ENSMUST00000212811 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 2410003L11Rik-202ENSMUST00000145262 642 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 277.8 ms