Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Tnfrsf9-203ENSMUST00000105671 1278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Gm12906-201ENSMUST00000154610 441 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Fcgr2b-203ENSMUST00000159688 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Gm45085-201ENSMUST00000209100 441 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Tnfrsf9-202ENSMUST00000060901 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Gm9791-201ENSMUST00000060997 447 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Gm5555-201ENSMUST00000120352 1111 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Gm11993-201ENSMUST00000121861 820 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Mrpl24-204ENSMUST00000121920 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Tspan32os-201ENSMUST00000131740 975 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Gm9372-201ENSMUST00000168454 430 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Krtcap2-204ENSMUST00000168900 582 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 2410002F23Rik-220ENSMUST00000191537 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 AC102847.1-202ENSMUST00000226313 1245 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Psca-201ENSMUST00000023265 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Uqcrc2-201ENSMUST00000033176 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Nos1-206ENSMUST00000142742 10123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Usp12Q9D9M2 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Usp12Q9D9M2 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Usp12Q9D9M2 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Usp12Q9D9M2 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Usp12Q9D9M2 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Usp12Q9D9M2 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Usp12Q9D9M2 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Usp12Q9D9M2 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Usp12Q9D9M2 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Usp12Q9D9M2 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Usp12Q9D9M2 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp12Q9D9M2 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp12Q9D9M2 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp12Q9D9M2 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp12Q9D9M2 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms