Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Scml4-201ENSMUST00000063063 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Atxn7l1-212ENSMUST00000146040 2973 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Cdc20b-204ENSMUST00000181568 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Lgi1-204ENSMUST00000196090 1789 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Srcap-201ENSMUST00000066582 4545 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Slc2a1-201ENSMUST00000030398 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Gm23061-201ENSMUST00000102348 116 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Gm5865-201ENSMUST00000198713 637 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 AC152922.1-201ENSMUST00000216518 1232 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 AC167364.1-201ENSMUST00000221495 784 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 AC116680.1-201ENSMUST00000222804 613 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Plat-201ENSMUST00000033941 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Sgk2-202ENSMUST00000117123 3034 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr92-202ENSMUST00000214994 2073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Fkbp5-206ENSMUST00000177939 3844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Zmynd8-204ENSMUST00000109262 2515 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Pax3-201ENSMUST00000004994 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Vti1a-202ENSMUST00000223690 4175 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 4933406C10Rik-202ENSMUST00000181670 1633 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Pygm-202ENSMUST00000113483 2583 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Gm20043-201ENSMUST00000222267 2565 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Gm27231-201ENSMUST00000185191 551 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 CT025679.1-201ENSMUST00000227106 449 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Hcst-201ENSMUST00000075062 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 BC028528-202ENSMUST00000090476 809 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Wfdc6a-201ENSMUST00000099096 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Slfn5-202ENSMUST00000108157 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28884-201ENSMUST00000190367 3994 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Igsf6-201ENSMUST00000047194 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Gm37843-201ENSMUST00000195213 2639 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Cap1-201ENSMUST00000069533 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms