Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Tctex1d1-201ENSMUST00000030248 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Hsdl1-204ENSMUST00000212517 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Smchd1-201ENSMUST00000127430 7052 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Wdr46-ps-201ENSMUST00000200591 1712 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 AU022252-203ENSMUST00000141112 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Tank-203ENSMUST00000112495 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Gm6714-201ENSMUST00000218677 2330 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Tmem131l-203ENSMUST00000192095 4774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Camk2b-210ENSMUST00000109815 3780 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Fanca-202ENSMUST00000118395 3274 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Rims2-204ENSMUST00000226410 3685 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Exoc7-202ENSMUST00000106411 3205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Platr4-203ENSMUST00000199155 2161 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 AC144938.1-201ENSMUST00000223994 2167 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Nbr1-203ENSMUST00000103099 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Smarca1-202ENSMUST00000088973 4798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Lox-202ENSMUST00000171470 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Pld5-203ENSMUST00000111167 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Gm38312-201ENSMUST00000195426 1746 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Git2-203ENSMUST00000112183 4886 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Oprm1-204ENSMUST00000063036 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Zfyve26-201ENSMUST00000021547 9391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Gm16518-201ENSMUST00000117960 508 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Gm29346-201ENSMUST00000188147 255 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Gm37806-201ENSMUST00000194524 6387 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Osbpl7-206ENSMUST00000168565 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Gm15651-201ENSMUST00000159953 2507 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Tcf4-203ENSMUST00000114977 3070 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Gm44062-201ENSMUST00000203312 4857 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Abca9-201ENSMUST00000044850 6384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Ddx25-201ENSMUST00000034612 6934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Celf3-215ENSMUST00000200342 3173 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Cenpj-203ENSMUST00000225951 4756 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Diaph1-201ENSMUST00000025337 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Umodl1-203ENSMUST00000114555 5041 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Prrg3-201ENSMUST00000048790 5931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Adar-204ENSMUST00000118341 2399 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Wnk1-224ENSMUST00000203030 8163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Gm43372-201ENSMUST00000202662 3016 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Gsdma3-202ENSMUST00000107508 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Mid1-214ENSMUST00000163810 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Ap5z1-201ENSMUST00000038699 3689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Thsd7a-206ENSMUST00000172356 10998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Scnn1b-201ENSMUST00000033161 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Phf8-202ENSMUST00000046962 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Palm2-201ENSMUST00000102904 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Top1-201ENSMUST00000109468 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Ndufab1-201ENSMUST00000033157 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Gm18466-201ENSMUST00000209147 499 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms