Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

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Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Calm4-201ENSMUST00000042219 917 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 2010001K21Rik-201ENSMUST00000060680 519 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Gm10581-201ENSMUST00000097986 231 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 F730016J06Rik-201ENSMUST00000126140 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Mrps23-201ENSMUST00000024486 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Sfxn1-201ENSMUST00000021930 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Scnn1g-201ENSMUST00000000221 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Gm38111-201ENSMUST00000194817 2741 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Hormad2-202ENSMUST00000109948 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Gm13104-201ENSMUST00000119651 1446 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Gm6783-201ENSMUST00000120916 1437 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Slc10a4-202ENSMUST00000201304 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Gm42851-201ENSMUST00000201325 1411 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 A930003A15Rik-201ENSMUST00000100083 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Trav13-2-201ENSMUST00000103658 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Gm11235-201ENSMUST00000117763 333 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Gm6517-201ENSMUST00000121056 511 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Gm12570-201ENSMUST00000122047 1030 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Gm14817-201ENSMUST00000148522 643 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Gm29200-201ENSMUST00000188118 1085 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Gm28893-201ENSMUST00000190951 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Kcne3-206ENSMUST00000207995 439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 AC124503.1-201ENSMUST00000218524 526 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Stau2-202ENSMUST00000054668 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Tmem181b-ps-201ENSMUST00000167717 1413 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 1700022A22Rik-202ENSMUST00000187130 1458 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Gm12829-201ENSMUST00000146346 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Rps23-ps1-201ENSMUST00000116115 425 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Gm14829-201ENSMUST00000121499 1138 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Gm15839-201ENSMUST00000138684 612 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Gm13393-201ENSMUST00000141935 396 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Rps23-ps2-201ENSMUST00000146939 432 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 H2al1e-201ENSMUST00000178979 494 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 H2al1b-201ENSMUST00000189531 495 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Gm8828-201ENSMUST00000196786 1290 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Gm44388-201ENSMUST00000204350 258 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Gm46349-201ENSMUST00000219678 917 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Olfr47-201ENSMUST00000078057 1059 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Gm4763-201ENSMUST00000081657 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 4930566F21Rik-201ENSMUST00000201177 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Gm4865-201ENSMUST00000196284 1309 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Npy1r-201ENSMUST00000039303 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Gm28624-201ENSMUST00000186430 2131 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Gm8122-201ENSMUST00000165988 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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