Protein–RNA interactions for Protein: Q99P72

Rtn4, Reticulon-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn4Q99P72 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rtn4Q99P72 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rtn4Q99P72 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rtn4Q99P72 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rtn4Q99P72 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtn4Q99P72 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtn4Q99P72 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtn4Q99P72 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtn4Q99P72 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtn4Q99P72 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtn4Q99P72 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtn4Q99P72 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtn4Q99P72 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtn4Q99P72 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtn4Q99P72 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtn4Q99P72 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtn4Q99P72 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtn4Q99P72 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtn4Q99P72 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtn4Q99P72 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtn4Q99P72 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtn4Q99P72 A930019D19Rik-201ENSMUST00000135360 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtn4Q99P72 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtn4Q99P72 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtn4Q99P72 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtn4Q99P72 Olfr762-ps1-201ENSMUST00000172948 927 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtn4Q99P72 Gm26820-201ENSMUST00000180764 1008 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtn4Q99P72 Gm21542-201ENSMUST00000182307 993 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtn4Q99P72 Gm29318-201ENSMUST00000185308 975 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtn4Q99P72 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtn4Q99P72 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtn4Q99P72 A930028O11Rik-201ENSMUST00000197219 1108 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtn4Q99P72 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtn4Q99P72 Gm19137-201ENSMUST00000213790 1164 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtn4Q99P72 Smim15-203ENSMUST00000224361 830 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtn4Q99P72 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtn4Q99P72 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtn4Q99P72 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtn4Q99P72 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtn4Q99P72 Resp18-201ENSMUST00000039534 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtn4Q99P72 Olfr1463-201ENSMUST00000064102 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtn4Q99P72 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtn4Q99P72 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtn4Q99P72 Olfr1307-202ENSMUST00000099606 939 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtn4Q99P72 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtn4Q99P72 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtn4Q99P72 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtn4Q99P72 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtn4Q99P72 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtn4Q99P72 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtn4Q99P72 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtn4Q99P72 Gm38195-201ENSMUST00000194247 1499 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtn4Q99P72 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtn4Q99P72 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtn4Q99P72 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtn4Q99P72 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtn4Q99P72 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtn4Q99P72 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtn4Q99P72 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtn4Q99P72 Meiob-201ENSMUST00000024972 1703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtn4Q99P72 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtn4Q99P72 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtn4Q99P72 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtn4Q99P72 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtn4Q99P72 Dbi-202ENSMUST00000112648 504 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtn4Q99P72 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtn4Q99P72 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtn4Q99P72 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtn4Q99P72 Platr16-202ENSMUST00000150529 545 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtn4Q99P72 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtn4Q99P72 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtn4Q99P72 Spink14-202ENSMUST00000162265 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtn4Q99P72 Gm9027-201ENSMUST00000165914 661 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtn4Q99P72 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtn4Q99P72 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtn4Q99P72 1700010J16Rik-202ENSMUST00000189116 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtn4Q99P72 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtn4Q99P72 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtn4Q99P72 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtn4Q99P72 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtn4Q99P72 Olfr692-202ENSMUST00000217827 1126 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtn4Q99P72 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtn4Q99P72 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtn4Q99P72 Dnajc5b-201ENSMUST00000029132 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtn4Q99P72 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtn4Q99P72 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtn4Q99P72 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtn4Q99P72 Cks2-201ENSMUST00000075853 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtn4Q99P72 Nutf2-ps1-201ENSMUST00000095978 864 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtn4Q99P72 Olfr692-201ENSMUST00000098152 1126 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtn4Q99P72 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtn4Q99P72 Gm9521-201ENSMUST00000206656 1516 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtn4Q99P72 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtn4Q99P72 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtn4Q99P72 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtn4Q99P72 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtn4Q99P72 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtn4Q99P72 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtn4Q99P72 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtn4Q99P72 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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