Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

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Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Gm46328-201ENSMUST00000217924 976 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Gm34868-201ENSMUST00000218341 530 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 AC164556.1-201ENSMUST00000221318 751 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Crygf-201ENSMUST00000027082 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Cstb-201ENSMUST00000005185 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Atp6v1e2-201ENSMUST00000065758 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Eif2s2-201ENSMUST00000099173 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Micu1-212ENSMUST00000179709 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Ttc1-201ENSMUST00000048578 1438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Gm12397-201ENSMUST00000117674 615 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Gm11957-201ENSMUST00000118304 779 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Rpl17-ps1-201ENSMUST00000119156 552 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Gm16263-201ENSMUST00000144680 502 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Gm26208-201ENSMUST00000158677 124 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Gm16619-201ENSMUST00000181817 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Gm28901-201ENSMUST00000188810 474 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Usp16Q99LG0 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Gm45680-201ENSMUST00000211135 214 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 AC170597.1-201ENSMUST00000221956 440 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 H2-Aa-201ENSMUST00000040655 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Olfr60-201ENSMUST00000075470 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Nt5dc1-202ENSMUST00000099973 761 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Usp16Q99LG0 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Usp16Q99LG0 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Usp16Q99LG0 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Usp16Q99LG0 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Usp16Q99LG0 Fxyd1-214ENSMUST00000206328 545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Cenpx-201ENSMUST00000026137 692 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Vps25-201ENSMUST00000007533 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Ptges3l-201ENSMUST00000093933 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Srd5a3-203ENSMUST00000113507 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Dnajc14-202ENSMUST00000217745 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 4932438H23Rik-201ENSMUST00000035689 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Tnk2-204ENSMUST00000115123 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Bcl2l1-206ENSMUST00000140436 1865 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Ncmap-203ENSMUST00000105858 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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