Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Gm21425-202ENSMUST00000195626 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc12Q8K2L8 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc12Q8K2L8 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc12Q8K2L8 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc12Q8K2L8 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc12Q8K2L8 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc12Q8K2L8 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc12Q8K2L8 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc12Q8K2L8 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc12Q8K2L8 Gm24161-201ENSMUST00000104592 130 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc12Q8K2L8 Mir1190-201ENSMUST00000116925 96 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc12Q8K2L8 Gm9095-201ENSMUST00000117607 881 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc12Q8K2L8 Gm9097-201ENSMUST00000120514 880 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc12Q8K2L8 Glmp-207ENSMUST00000176425 960 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc12Q8K2L8 Gm26379-201ENSMUST00000178125 138 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc12Q8K2L8 Rian-210ENSMUST00000182689 295 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc12Q8K2L8 Gm29157-201ENSMUST00000188753 612 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc12Q8K2L8 Mpzl1-203ENSMUST00000191818 853 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc12Q8K2L8 Gm32939-201ENSMUST00000222336 843 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc12Q8K2L8 AC127583.1-201ENSMUST00000224351 540 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc12Q8K2L8 Olfr1219-201ENSMUST00000099797 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc12Q8K2L8 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc12Q8K2L8 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc12Q8K2L8 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc12Q8K2L8 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc12Q8K2L8 Gm45076-201ENSMUST00000207517 1517 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc12Q8K2L8 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc12Q8K2L8 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc12Q8K2L8 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Trappc12Q8K2L8 Gm7190-201ENSMUST00000118669 1452 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc12Q8K2L8 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc12Q8K2L8 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc12Q8K2L8 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc12Q8K2L8 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc12Q8K2L8 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc12Q8K2L8 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc12Q8K2L8 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc12Q8K2L8 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc12Q8K2L8 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc12Q8K2L8 Hat1-201ENSMUST00000028408 1576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc12Q8K2L8 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc12Q8K2L8 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc12Q8K2L8 Olfr464-205ENSMUST00000217112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc12Q8K2L8 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc12Q8K2L8 Dnaja1-201ENSMUST00000030118 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc12Q8K2L8 Ighv1-56-201ENSMUST00000103527 294 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
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Trappc12Q8K2L8 Gm17225-201ENSMUST00000172051 497 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc12Q8K2L8 D130017N08Rik-201ENSMUST00000180460 510 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc12Q8K2L8 Zfp787-203ENSMUST00000207331 376 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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Trappc12Q8K2L8 Dytn-201ENSMUST00000090313 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc12Q8K2L8 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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Trappc12Q8K2L8 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Trappc12Q8K2L8 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc12Q8K2L8 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Trappc12Q8K2L8 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc12Q8K2L8 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc12Q8K2L8 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc12Q8K2L8 Slc35b3-201ENSMUST00000021870 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc12Q8K2L8 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc12Q8K2L8 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc12Q8K2L8 Galntl5-202ENSMUST00000114965 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc12Q8K2L8 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc12Q8K2L8 Dpm1-202ENSMUST00000109193 1076 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc12Q8K2L8 Gm13215-201ENSMUST00000117559 472 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc12Q8K2L8 Rplp1-ps1-201ENSMUST00000119410 345 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc12Q8K2L8 Zfp738-202ENSMUST00000125495 712 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc12Q8K2L8 Gm13580-201ENSMUST00000131457 566 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc12Q8K2L8 Gm23999-201ENSMUST00000158057 104 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc12Q8K2L8 Gm16226-204ENSMUST00000162639 423 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc12Q8K2L8 Actb-207ENSMUST00000167721 1242 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc12Q8K2L8 Tead1-211ENSMUST00000170352 1218 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc12Q8K2L8 Krtap6-3-202ENSMUST00000185581 520 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Trappc12Q8K2L8 AC124581.2-201ENSMUST00000225459 282 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.6 ms