Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFC7

Clasrp, CLK4-associating serine/arginine rich protein, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClasrpQ8CFC7 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ClasrpQ8CFC7 Tcaf1-202ENSMUST00000045140 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ClasrpQ8CFC7 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ClasrpQ8CFC7 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ClasrpQ8CFC7 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ClasrpQ8CFC7 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ClasrpQ8CFC7 Rnf123-207ENSMUST00000160249 4426 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ClasrpQ8CFC7 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ClasrpQ8CFC7 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ClasrpQ8CFC7 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ClasrpQ8CFC7 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ClasrpQ8CFC7 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ClasrpQ8CFC7 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ClasrpQ8CFC7 Gm13333-201ENSMUST00000119424 781 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ClasrpQ8CFC7 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ClasrpQ8CFC7 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ClasrpQ8CFC7 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ClasrpQ8CFC7 Gm12570-201ENSMUST00000122047 1030 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ClasrpQ8CFC7 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ClasrpQ8CFC7 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ClasrpQ8CFC7 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ClasrpQ8CFC7 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ClasrpQ8CFC7 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ClasrpQ8CFC7 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ClasrpQ8CFC7 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ClasrpQ8CFC7 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ClasrpQ8CFC7 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ClasrpQ8CFC7 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ClasrpQ8CFC7 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ClasrpQ8CFC7 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ClasrpQ8CFC7 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ClasrpQ8CFC7 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ClasrpQ8CFC7 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ClasrpQ8CFC7 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ClasrpQ8CFC7 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ClasrpQ8CFC7 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ClasrpQ8CFC7 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ClasrpQ8CFC7 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ClasrpQ8CFC7 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ClasrpQ8CFC7 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ClasrpQ8CFC7 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ClasrpQ8CFC7 AC129323.1-201ENSMUST00000216733 470 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ClasrpQ8CFC7 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ClasrpQ8CFC7 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ClasrpQ8CFC7 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ClasrpQ8CFC7 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ClasrpQ8CFC7 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ClasrpQ8CFC7 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ClasrpQ8CFC7 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ClasrpQ8CFC7 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ClasrpQ8CFC7 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ClasrpQ8CFC7 Gm28693-201ENSMUST00000189622 2638 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ClasrpQ8CFC7 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ClasrpQ8CFC7 Acan-201ENSMUST00000032835 7355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ClasrpQ8CFC7 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ClasrpQ8CFC7 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ClasrpQ8CFC7 Bicd1-203ENSMUST00000111513 4049 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ClasrpQ8CFC7 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ClasrpQ8CFC7 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ClasrpQ8CFC7 Gm20715-201ENSMUST00000054781 4460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ClasrpQ8CFC7 Gm16576-201ENSMUST00000128342 5404 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ClasrpQ8CFC7 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ClasrpQ8CFC7 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ClasrpQ8CFC7 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ClasrpQ8CFC7 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ClasrpQ8CFC7 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ClasrpQ8CFC7 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ClasrpQ8CFC7 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ClasrpQ8CFC7 Rnf216-201ENSMUST00000053498 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ClasrpQ8CFC7 Lig3-210ENSMUST00000173347 3631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ClasrpQ8CFC7 Atxn1l-201ENSMUST00000093162 7526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ClasrpQ8CFC7 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ClasrpQ8CFC7 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ClasrpQ8CFC7 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ClasrpQ8CFC7 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ClasrpQ8CFC7 Svil-204ENSMUST00000127297 6243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ClasrpQ8CFC7 Celsr3-201ENSMUST00000024238 11547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ClasrpQ8CFC7 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ClasrpQ8CFC7 Shroom2-202ENSMUST00000101141 7494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ClasrpQ8CFC7 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ClasrpQ8CFC7 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ClasrpQ8CFC7 Gm12224-201ENSMUST00000124047 567 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ClasrpQ8CFC7 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ClasrpQ8CFC7 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ClasrpQ8CFC7 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ClasrpQ8CFC7 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ClasrpQ8CFC7 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ClasrpQ8CFC7 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ClasrpQ8CFC7 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ClasrpQ8CFC7 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ClasrpQ8CFC7 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ClasrpQ8CFC7 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ClasrpQ8CFC7 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ClasrpQ8CFC7 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ClasrpQ8CFC7 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ClasrpQ8CFC7 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ClasrpQ8CFC7 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ClasrpQ8CFC7 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ClasrpQ8CFC7 St5-201ENSMUST00000077909 4612 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ClasrpQ8CFC7 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms