Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc9Q8CDN9 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc9Q8CDN9 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc9Q8CDN9 Gm12551-201ENSMUST00000122073 726 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc9Q8CDN9 Gm13465-201ENSMUST00000129687 979 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc9Q8CDN9 Gm13938-201ENSMUST00000156809 493 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc9Q8CDN9 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc9Q8CDN9 Gm44204-201ENSMUST00000204722 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc9Q8CDN9 AC100406.1-201ENSMUST00000217305 480 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc9Q8CDN9 5330411J11Rik-201ENSMUST00000137162 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc9Q8CDN9 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc9Q8CDN9 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc9Q8CDN9 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc9Q8CDN9 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc9Q8CDN9 Abcc9-205ENSMUST00000204870 1458 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc9Q8CDN9 Gm5099-201ENSMUST00000194892 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc9Q8CDN9 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc9Q8CDN9 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc9Q8CDN9 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc9Q8CDN9 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc9Q8CDN9 Hmg20a-205ENSMUST00000215269 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc9Q8CDN9 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc9Q8CDN9 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc9Q8CDN9 Vgll3-202ENSMUST00000227997 1383 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc9Q8CDN9 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc9Q8CDN9 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc9Q8CDN9 Aqp7-202ENSMUST00000054945 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc9Q8CDN9 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc9Q8CDN9 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc9Q8CDN9 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc9Q8CDN9 Hs1bp3-201ENSMUST00000020927 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc9Q8CDN9 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Gzmg-201ENSMUST00000015578 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Gm16581-201ENSMUST00000160730 991 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 5730420D15Rik-201ENSMUST00000181781 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Gm26930-201ENSMUST00000194874 1244 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Cyp2e1-203ENSMUST00000210235 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 AC160109.1-201ENSMUST00000225592 729 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Mapk1ip1-202ENSMUST00000118810 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Gm5054-201ENSMUST00000119351 453 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Gm15798-201ENSMUST00000120082 408 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Gm14138-201ENSMUST00000122061 745 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Pabpn1-203ENSMUST00000139985 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Gm26679-201ENSMUST00000181685 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 H2al1a-201ENSMUST00000188439 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Gm38153-201ENSMUST00000195484 472 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 6430531B16Rik-205ENSMUST00000210254 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Flt3l-210ENSMUST00000211246 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 AC093022.2-202ENSMUST00000227500 866 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Gm42449-201ENSMUST00000200349 2258 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 CT009713.3-201ENSMUST00000224987 1565 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Ly6e-202ENSMUST00000169343 2154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Gm9583-201ENSMUST00000219613 1843 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Gm14278-201ENSMUST00000117381 878 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Gm15554-201ENSMUST00000120406 913 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Gm12962-201ENSMUST00000138697 580 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 4930448D08Rik-201ENSMUST00000149958 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 1700001J04Rik-202ENSMUST00000154037 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Gm22009-201ENSMUST00000158792 343 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Gm16118-201ENSMUST00000161914 680 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Wars2-205ENSMUST00000198044 403 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Gm32710-201ENSMUST00000210677 618 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 AC124173.1-201ENSMUST00000223701 189 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Smim4-201ENSMUST00000049732 311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Cox7a1-201ENSMUST00000098594 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 4930432L08Rik-201ENSMUST00000132154 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Ces1a-201ENSMUST00000095211 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Ube2q1-202ENSMUST00000196726 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms