Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Gm44420-201ENSMUST00000203669 490 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Zbtb8b-201ENSMUST00000053042 3288 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Atg4b-201ENSMUST00000027502 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Tubgcp5-205ENSMUST00000205796 3448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Spert-201ENSMUST00000035243 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Ldlr-201ENSMUST00000034713 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Vmn1r184-207ENSMUST00000228369 6361 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 4933422A05Rik-201ENSMUST00000213706 1356 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Inhbe-201ENSMUST00000059718 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Cxcr2-201ENSMUST00000027372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Sh2d3c-201ENSMUST00000074248 3092 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Cd163-201ENSMUST00000032234 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Odf2-207ENSMUST00000113762 2353 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Slc25a27-201ENSMUST00000024705 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Gm37583-201ENSMUST00000195460 2487 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Mfsd2b-201ENSMUST00000045921 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Ano2-204ENSMUST00000160496 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Wnk1-224ENSMUST00000203030 8163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Amer3-201ENSMUST00000052670 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Txlng-204ENSMUST00000112316 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 2310002L09Rik-202ENSMUST00000095023 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Med12l-206ENSMUST00000199659 11006 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Arel1-201ENSMUST00000043169 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Gm16518-201ENSMUST00000117960 508 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Gm15554-201ENSMUST00000120406 913 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Omt2b-203ENSMUST00000187667 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Dzank1-201ENSMUST00000081982 6847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Lyn-201ENSMUST00000041377 3463 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Smarcc2-202ENSMUST00000099131 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Gsdma3-202ENSMUST00000107508 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Gm43517-201ENSMUST00000110746 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Vangl1-208ENSMUST00000168312 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 9130019O22Rik-201ENSMUST00000049052 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Daam1-201ENSMUST00000085299 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Mcc-201ENSMUST00000089874 7858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Dock4-204ENSMUST00000220912 7360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Kctd7-201ENSMUST00000040616 4291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Myo18a-201ENSMUST00000000645 7307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Myo18a-203ENSMUST00000092887 7304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 C130026L21Rik-204ENSMUST00000199587 1838 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Casq2-205ENSMUST00000165540 2434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Epn2-204ENSMUST00000108713 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Nlgn3-206ENSMUST00000151528 8541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Mov10-203ENSMUST00000106775 3584 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Mov10-206ENSMUST00000166979 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Hal-202ENSMUST00000129421 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Cckar-202ENSMUST00000200691 3230 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 4631405J19Rik-202ENSMUST00000111270 2909 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Prrg3-201ENSMUST00000048790 5931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Celsr3-201ENSMUST00000024238 11547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 C920021L13Rik-201ENSMUST00000120398 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Gm38312-201ENSMUST00000195426 1746 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Ccdc33-204ENSMUST00000119665 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Acbd5-212ENSMUST00000227663 4566 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Gm45837-201ENSMUST00000084894 4139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Gm16226-204ENSMUST00000162639 423 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms