Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWR4

Usp40, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 40, mousemouse

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Length 1,235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usp40Q8BWR4 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp40Q8BWR4 Gm7319-201ENSMUST00000210047 778 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
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Usp40Q8BWR4 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp40Q8BWR4 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp40Q8BWR4 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp40Q8BWR4 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Usp40Q8BWR4 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Olfr272-202ENSMUST00000107667 1936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Hmox1-201ENSMUST00000005548 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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