Protein–RNA interactions for Protein: Q80W37

Snupn, Snurportin-1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnupnQ80W37 Pfdn5-203ENSMUST00000165671 830 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Ccnb1-207ENSMUST00000174038 1182 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Vmn1r-ps63-201ENSMUST00000174565 989 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Gm24328-201ENSMUST00000175104 67 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Cdhr4-208ENSMUST00000176373 492 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Gm27211-201ENSMUST00000183507 631 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 2610016A17Rik-201ENSMUST00000185211 474 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Gm28096-201ENSMUST00000191391 824 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Gm45388-201ENSMUST00000209922 1132 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 AC162938.2-202ENSMUST00000215497 722 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Gm14005-208ENSMUST00000223654 681 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Acot13-201ENSMUST00000006900 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Krtap12-1-201ENSMUST00000092370 656 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Olfr372-201ENSMUST00000093434 1016 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Gm28581-201ENSMUST00000186086 2177 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Ilf3-202ENSMUST00000115414 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Olfr463-203ENSMUST00000217095 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Atp5g3-202ENSMUST00000111996 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Gm8659-201ENSMUST00000120024 1084 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Fxyd5-203ENSMUST00000159924 805 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Fxyd5-210ENSMUST00000162116 817 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Gm27440-201ENSMUST00000184785 107 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Gm43610-201ENSMUST00000199117 365 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Gm43506-201ENSMUST00000200675 753 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Gm31520-203ENSMUST00000204874 647 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Gm45469-201ENSMUST00000210468 854 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 AC134793.1-202ENSMUST00000227444 803 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 AC164099.1-201ENSMUST00000227780 333 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Nkg7-201ENSMUST00000070518 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Palld-201ENSMUST00000034057 3566 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Magea2-202ENSMUST00000112559 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Phf21a-202ENSMUST00000068702 6023 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Sec13-201ENSMUST00000032440 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Adam20-201ENSMUST00000056331 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Zmynd8-221ENSMUST00000177633 5093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81 ms