Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Il16-203ENSMUST00000145610 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Zfp110-201ENSMUST00000004614 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Gm45170-201ENSMUST00000206746 1671 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Gm45663-201ENSMUST00000210429 1632 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Vbp1-201ENSMUST00000033540 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Mapk1ip1-201ENSMUST00000075667 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Gm38111-201ENSMUST00000194817 2741 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Dnaja1-201ENSMUST00000030118 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Hormad2-202ENSMUST00000109948 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Tpm1-205ENSMUST00000113685 1208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Gm12009-201ENSMUST00000121361 1100 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Aif1l-207ENSMUST00000148056 670 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Gm6471-202ENSMUST00000148734 587 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Vmn2r-ps13-201ENSMUST00000176920 606 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Gm18443-201ENSMUST00000185358 556 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Gm28356-201ENSMUST00000186941 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Gm36307-201ENSMUST00000195831 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Gm7319-201ENSMUST00000210047 778 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Gm34983-202ENSMUST00000220432 494 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 AC139155.1-201ENSMUST00000226043 444 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Gm5424-201ENSMUST00000053865 1240 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Olfr1219-201ENSMUST00000099797 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Dph5-202ENSMUST00000106505 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Btc-201ENSMUST00000121044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Morf4l2-213ENSMUST00000166478 1720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 AC154220.1-201ENSMUST00000225033 1705 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Gm12097-201ENSMUST00000121523 1414 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Gm44975-201ENSMUST00000207435 1390 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Gm8725-201ENSMUST00000221829 1333 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Tpd52-202ENSMUST00000091354 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Gm6517-201ENSMUST00000121056 511 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Gm45591-201ENSMUST00000129058 843 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Gm5976-201ENSMUST00000180794 996 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Ly6e-207ENSMUST00000187606 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Gm28505-201ENSMUST00000190466 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Gm44388-201ENSMUST00000204350 258 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Gm18862-201ENSMUST00000204643 933 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 AC159282.1-204ENSMUST00000219472 780 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Olfr1394-201ENSMUST00000052668 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trak1Q6PD31 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trak1Q6PD31 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trak1Q6PD31 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trak1Q6PD31 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trak1Q6PD31 Hmox1-201ENSMUST00000005548 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trak1Q6PD31 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trak1Q6PD31 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trak1Q6PD31 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trak1Q6PD31 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trak1Q6PD31 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trak1Q6PD31 1700022A22Rik-202ENSMUST00000187130 1458 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms