Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Nmb-201ENSMUST00000026817 705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Elobl-202ENSMUST00000082339 300 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Mgst2-201ENSMUST00000099106 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Cyp2b13-201ENSMUST00000005669 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 4933425M03Rik-201ENSMUST00000195991 1544 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Ccdc83-201ENSMUST00000040413 1546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Sh2d1a-203ENSMUST00000115070 782 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Gm13134-201ENSMUST00000132106 738 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 4933439K11Rik-202ENSMUST00000140307 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Gm12737-201ENSMUST00000142835 725 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 1700019D03Rik-206ENSMUST00000190831 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Gm42067-202ENSMUST00000210917 410 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Spns3-201ENSMUST00000021154 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Pdgfd-202ENSMUST00000168039 1795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 1700092E19Rik-202ENSMUST00000154703 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Dcstamp-205ENSMUST00000228556 1684 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Gtf2ird1-206ENSMUST00000111244 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Gm14111-201ENSMUST00000119851 999 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Ighv5-10-201ENSMUST00000194591 252 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Gm39348-201ENSMUST00000216861 640 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Rce1-203ENSMUST00000224707 1255 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Tex29-201ENSMUST00000033909 822 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Gm8055-201ENSMUST00000099956 1008 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 5830473C10Rik-202ENSMUST00000200765 1691 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Mcph1-205ENSMUST00000146819 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Picalm-201ENSMUST00000049537 3528 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Gm15535-202ENSMUST00000148478 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Olfr30-202ENSMUST00000215691 2404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Phactr1-214ENSMUST00000149235 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Ighv8-6-201ENSMUST00000103524 301 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Gm23899-201ENSMUST00000158112 90 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Gm6773-201ENSMUST00000182377 878 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Gm31135-202ENSMUST00000208946 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Cryab-206ENSMUST00000217475 1117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Gm5189-201ENSMUST00000221796 261 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Ifitm7-202ENSMUST00000178021 1823 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Olfr62-201ENSMUST00000102666 949 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Ighv2-2-201ENSMUST00000103443 352 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Apoc2-203ENSMUST00000142352 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Gm12976-201ENSMUST00000150171 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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