Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Rnf121-201ENSMUST00000089052 2344 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Phf21a-203ENSMUST00000090586 6310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Eif2s3y-201ENSMUST00000091197 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Myo18a-203ENSMUST00000092887 7304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Uvssa-201ENSMUST00000087864 7326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 2310057M21Rik-201ENSMUST00000059438 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Pkd1l3-203ENSMUST00000212537 6576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Ctnnd1-207ENSMUST00000111676 5852 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Tulp4-209ENSMUST00000149756 8784 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Rph3a-204ENSMUST00000202406 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 E2f7-204ENSMUST00000173471 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Ilf3-203ENSMUST00000213518 3513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Limk1-202ENSMUST00000111233 3109 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Slc25a13-201ENSMUST00000015256 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Padi3-201ENSMUST00000026377 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Fignl1-207ENSMUST00000171938 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Cage1-203ENSMUST00000110233 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Gm12498-201ENSMUST00000138374 2458 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Fbxo32-201ENSMUST00000022986 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Gpa33-204ENSMUST00000166860 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Celf2-224ENSMUST00000182879 2223 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Gm28593-201ENSMUST00000190989 2170 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Kdm2b-205ENSMUST00000121739 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Map1a-202ENSMUST00000110639 10145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Gm37516-201ENSMUST00000192593 1954 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Zic3-201ENSMUST00000088627 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Baat-201ENSMUST00000043056 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Gemin8-202ENSMUST00000087169 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Samsn1-201ENSMUST00000114239 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Cyp2g1-201ENSMUST00000040944 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Cngb1-204ENSMUST00000121162 3336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Olfr569-202ENSMUST00000217024 4741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Vps8-205ENSMUST00000118138 3060 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Ccpg1-202ENSMUST00000085350 2969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Zfp677-201ENSMUST00000056107 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Fam124b-201ENSMUST00000058748 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Pus7l-201ENSMUST00000049151 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Phf21a-205ENSMUST00000111291 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Dhx32-202ENSMUST00000063669 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Fndc7-202ENSMUST00000102620 3477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Sept6-202ENSMUST00000060474 3457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Tnr-201ENSMUST00000111669 4424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Zfp532-208ENSMUST00000182852 5476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Xrcc6-201ENSMUST00000069530 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Gm12576-201ENSMUST00000135268 3036 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Plcd4-201ENSMUST00000027362 2977 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Zfp462-201ENSMUST00000030131 4823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Plscr2-205ENSMUST00000180154 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Irf4-202ENSMUST00000110307 4761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Irf4-201ENSMUST00000021784 4764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Dab2-202ENSMUST00000080880 4663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Gm15666-202ENSMUST00000219490 2796 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Cpsf1-201ENSMUST00000071898 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Miga2-202ENSMUST00000100214 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Morf4l2-215ENSMUST00000169418 1782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Nadsyn1-201ENSMUST00000033415 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 AC242690.1-202ENSMUST00000214616 1742 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Gm45289-201ENSMUST00000211048 2577 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Ctc1-201ENSMUST00000021278 4164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 1700001J11Rik-202ENSMUST00000190330 2463 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Sncaip-203ENSMUST00000163742 3272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Gm16630-201ENSMUST00000180741 3257 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Spats2l-206ENSMUST00000167085 3929 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Frmd6-201ENSMUST00000057859 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Nkiras1-202ENSMUST00000132374 4598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Akap6-202ENSMUST00000219786 4564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms