Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16240-201ENSMUST00000161924 614 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Gm3371-202ENSMUST00000177827 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Mrgprc3-ps-201ENSMUST00000189876 955 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm20559-201ENSMUST00000201032 433 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37797-201ENSMUST00000212114 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
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Gtpbp6Q3U6U5 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r183-201ENSMUST00000086012 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gtpbp6Q3U6U5 2310016G11Rik-201ENSMUST00000094460 992 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr441-201ENSMUST00000095954 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gtpbp6Q3U6U5 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
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Gtpbp6Q3U6U5 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
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Gtpbp6Q3U6U5 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7951-201ENSMUST00000171388 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
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Gtpbp6Q3U6U5 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
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Gtpbp6Q3U6U5 Dppa3-201ENSMUST00000049644 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr165-201ENSMUST00000052516 1040 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
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Gtpbp6Q3U6U5 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
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Gtpbp6Q3U6U5 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gtpbp6Q3U6U5 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gtpbp6Q3U6U5 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms