Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Nt5dc1-202ENSMUST00000099973 761 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Gm38312-201ENSMUST00000195426 1746 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Gm8684-201ENSMUST00000195078 1564 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Gm22594-201ENSMUST00000104251 130 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 S100a3-201ENSMUST00000001047 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Gm5555-201ENSMUST00000120352 1111 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Gm14957-201ENSMUST00000121069 817 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Gm35202-201ENSMUST00000130083 712 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Tex29-204ENSMUST00000166638 561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Gm9625-201ENSMUST00000180422 955 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Mir6387-201ENSMUST00000184042 108 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Gm28671-201ENSMUST00000187036 692 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Gm29283-201ENSMUST00000187394 288 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 1700029M03Rik-202ENSMUST00000187517 357 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Tcstv1-202ENSMUST00000190512 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 2610001A08Rik-201ENSMUST00000193315 867 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Gm18010-201ENSMUST00000203553 202 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Gm45670-201ENSMUST00000211382 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Gm19885-201ENSMUST00000212853 343 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 AC154527.3-201ENSMUST00000225519 989 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 AC154634.2-201ENSMUST00000225983 1184 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Vpreb3-201ENSMUST00000000926 625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Gm45177-201ENSMUST00000209104 2307 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Micu1-212ENSMUST00000179709 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 C920021L13Rik-201ENSMUST00000120398 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Gm26908-201ENSMUST00000181856 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 AC151836.1-201ENSMUST00000228730 1637 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Samd13-202ENSMUST00000125965 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Gm20121-201ENSMUST00000198547 1594 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Npy1r-201ENSMUST00000039303 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Cpvl-202ENSMUST00000203101 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Gm12474-201ENSMUST00000122898 1410 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 E330011O21Rik-204ENSMUST00000210839 1361 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Magea2-202ENSMUST00000112559 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Gm19951-201ENSMUST00000222616 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Rpusd2Q149F1 Prl8a8-202ENSMUST00000110350 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Gm16459-201ENSMUST00000121443 686 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
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Rpusd2Q149F1 Stk33-205ENSMUST00000141210 949 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Cdhr4-208ENSMUST00000176373 492 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Gm16894-201ENSMUST00000181756 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Gm28941-201ENSMUST00000185536 1017 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
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Rpusd2Q149F1 Gm45094-201ENSMUST00000207013 617 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Gpr137b-ps-202ENSMUST00000220647 1159 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Gm36525-201ENSMUST00000222590 638 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Msmb-201ENSMUST00000022464 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 AC174797.2-201ENSMUST00000225835 165 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Olfr855-201ENSMUST00000061693 992 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Olfr372-201ENSMUST00000093434 1016 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 n-R5s71-201ENSMUST00000093668 119 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Zfp850-201ENSMUST00000099111 941 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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