Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Ttc39dQ0VF76 Qtrt2-201ENSMUST00000023387 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Pax6-207ENSMUST00000111087 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Ttc39dQ0VF76 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Hrh1-201ENSMUST00000088987 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Ttc39dQ0VF76 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Ttc39dQ0VF76 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Zfp474-201ENSMUST00000072666 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Morf4l2-215ENSMUST00000169418 1782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Tex45-201ENSMUST00000047265 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Ttc39dQ0VF76 Nln-205ENSMUST00000224945 2486 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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