Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Gm3687-201ENSMUST00000161710 460 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Il24-202ENSMUST00000187650 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 4930500F04Rik-203ENSMUST00000202177 576 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Gm26397-201ENSMUST00000083703 134 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Rasgrp1-203ENSMUST00000172901 1903 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Olfr463-202ENSMUST00000215150 2031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Tph1-202ENSMUST00000107669 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Zfp956-201ENSMUST00000101445 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 5830473C10Rik-202ENSMUST00000200765 1691 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Vpreb3-202ENSMUST00000121151 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Gm10639-202ENSMUST00000121273 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Gm40-201ENSMUST00000122131 660 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Tmem265-202ENSMUST00000190278 587 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Gm34358-201ENSMUST00000204585 665 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Gm29803-201ENSMUST00000205069 375 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Gm45363-201ENSMUST00000210196 1294 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 AC118704.1-201ENSMUST00000225022 695 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Figla-201ENSMUST00000032070 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Olfr1219-201ENSMUST00000099797 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Hmg20a-205ENSMUST00000215269 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Fmo3-201ENSMUST00000028010 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Ccdc32-203ENSMUST00000110834 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Gm11307-201ENSMUST00000121088 929 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 1700028P15Rik-202ENSMUST00000139894 856 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Gm17120-201ENSMUST00000164734 743 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Gm26679-201ENSMUST00000181685 659 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Gm18362-201ENSMUST00000221786 529 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Magoh-201ENSMUST00000030348 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Hesx1-201ENSMUST00000035433 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Gpatch1-201ENSMUST00000079693 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Tmem106a-201ENSMUST00000039581 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Prim1-201ENSMUST00000026461 1583 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Gm6285-201ENSMUST00000122012 498 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 1700019E08Rik-201ENSMUST00000134308 424 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Mettl18-201ENSMUST00000045694 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Inpp5b-201ENSMUST00000094782 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Zfp386-201ENSMUST00000073551 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Ccnc-202ENSMUST00000102997 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Gm12962-201ENSMUST00000138697 580 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Gnb2-214ENSMUST00000168746 802 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Gm28281-201ENSMUST00000185658 187 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Ngf-204ENSMUST00000198644 1120 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Gm39090-201ENSMUST00000205284 972 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Gm45521-201ENSMUST00000211339 676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Trap1a-201ENSMUST00000054534 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Ptpn7-201ENSMUST00000049449 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Pcdhb10-201ENSMUST00000051126 2851 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Myc-207ENSMUST00000188482 1365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Myc-208ENSMUST00000191178 1362 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms