Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Bud31-203ENSMUST00000160075 928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Vmn2r-ps13-201ENSMUST00000176920 606 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Rian-210ENSMUST00000182689 295 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Gm4960-201ENSMUST00000182928 1001 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Gm7627-201ENSMUST00000183205 999 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Gm18443-201ENSMUST00000185358 556 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Gm28893-201ENSMUST00000190951 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Gm37872-201ENSMUST00000192362 886 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Gm43821-201ENSMUST00000199198 729 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Gm45308-201ENSMUST00000210610 415 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 AC107711.4-201ENSMUST00000228948 440 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Ndufc1-201ENSMUST00000038108 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Tceanc2-203ENSMUST00000058585 766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Nkg7-201ENSMUST00000070518 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Rps3a3-201ENSMUST00000074680 795 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Tdpoz4-201ENSMUST00000075953 1113 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Prok2-201ENSMUST00000008273 594 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Krtap3-2-201ENSMUST00000092699 1031 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Vmn1r212-201ENSMUST00000095960 1164 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Il1f5-205ENSMUST00000147885 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Gstm6-204ENSMUST00000106684 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Wfdc3-202ENSMUST00000109328 726 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Atp5g3-202ENSMUST00000111996 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Tpm1-205ENSMUST00000113685 1208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Ppt1-204ENSMUST00000121870 986 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Gm24078-201ENSMUST00000158184 103 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Gm11942-201ENSMUST00000180255 345 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Mir6953-201ENSMUST00000184745 68 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 1700048F04Rik-201ENSMUST00000199057 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Gm6426-201ENSMUST00000209048 854 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 BC049987-201ENSMUST00000213859 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Gm39464-201ENSMUST00000214091 2169 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Gm7904-201ENSMUST00000217049 465 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Gm34983-202ENSMUST00000220432 494 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 CAAA01139602.1-201ENSMUST00000222545 283 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 AC161052.1-201ENSMUST00000222856 910 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Gm14005-208ENSMUST00000223654 681 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Ebi3-201ENSMUST00000003274 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Tnfrsf18-201ENSMUST00000040274 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Olfr1219-201ENSMUST00000099797 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Nr1h4-201ENSMUST00000058126 1964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Gm16429-202ENSMUST00000201400 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Gm7971-201ENSMUST00000086950 1848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Gm45076-201ENSMUST00000207517 1517 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Ankrd36-201ENSMUST00000109855 1363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Ppid-201ENSMUST00000029382 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Gm45663-201ENSMUST00000210429 1632 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Gm38111-201ENSMUST00000194817 2741 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Lonp2-207ENSMUST00000163987 1556 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Gm37516-201ENSMUST00000192593 1954 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Lrrc23-202ENSMUST00000112475 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 A930003A15Rik-201ENSMUST00000100083 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Upp1-202ENSMUST00000101525 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Gm22751-201ENSMUST00000102077 109 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms